20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0994 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0994  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  1106    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0989  hypothetical protein  36.53 
 
 		 595 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00830032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0891  hypothetical protein  33.76 
 
 		 554 aa  247  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93749e-28 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2295  hypothetical protein  33.98 
 
 		 500 aa  236  9e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3354  hypothetical protein  34.1 
 
 		 611 aa  231  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00026659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3284  hypothetical protein  33.73 
 
 		 593 aa  227  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000750415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2737  polyheme membrane-associated cytochrome c  37.44 
 
 		 744 aa  204  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  32.57 
 
 		 1110 aa  204  4e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  34.01 
 
 		 768 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  33.06 
 
 		 1106 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  31.36 
 
 		 812 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  31.69 
 
 		 1294 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  31.26 
 
 		 490 aa  162  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  27.06 
 
 		 1601 aa  143  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3156  hypothetical protein  31.2 
 
 		 946 aa  134  3e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  29.61 
 
 		 783 aa  134  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  29.65 
 
 		 789 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  25.19 
 
 		 867 aa  79.7  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  28.28 
 
 		 916 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  25.55 
 
 		 337 aa  47  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>