21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0867 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  100 
 
 
783 aa  1621    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  75.53 
 
 
789 aa  1223    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2737  polyheme membrane-associated cytochrome c  39.57 
 
 
744 aa  451  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  37.1 
 
 
768 aa  431  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3156  hypothetical protein  31.05 
 
 
946 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0989  hypothetical protein  30.9 
 
 
595 aa  151  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00830032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0994  hypothetical protein  28.57 
 
 
534 aa  137  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  31.9 
 
 
1601 aa  135  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  30.46 
 
 
1106 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  29.79 
 
 
1110 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2295  hypothetical protein  36.32 
 
 
500 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  26.42 
 
 
812 aa  106  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  25.55 
 
 
1294 aa  99.4  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0891  hypothetical protein  25.95 
 
 
554 aa  97.8  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93749e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3354  hypothetical protein  25.71 
 
 
611 aa  92.4  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00026659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3284  hypothetical protein  24.11 
 
 
593 aa  81.6  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000750415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  26.13 
 
 
490 aa  54.7  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  22.59 
 
 
867 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  31.55 
 
 
916 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  33.6 
 
 
266 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  34.4 
 
 
266 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>