25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3154 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  100 
 
 		 812 aa  1660    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  41.92 
 
 		 1110 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  41.22 
 
 		 1106 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0891  hypothetical protein  30.78 
 
 		 554 aa  218  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93749e-28 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3156  hypothetical protein  36.59 
 
 		 946 aa  213  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3284  hypothetical protein  32.34 
 
 		 593 aa  204  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000750415  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  34.73 
 
 		 768 aa  195  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2737  polyheme membrane-associated cytochrome c  35.31 
 
 		 744 aa  196  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3354  hypothetical protein  31.73 
 
 		 611 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00026659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0994  hypothetical protein  31.19 
 
 		 534 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0989  hypothetical protein  29.19 
 
 		 595 aa  157  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00830032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1294 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2295  hypothetical protein  29.22 
 
 		 500 aa  147  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  26.97 
 
 		 1601 aa  140  7e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  29.6 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  26.42 
 
 		 783 aa  106  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  26.36 
 
 		 789 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  24.2 
 
 		 867 aa  69.3  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 2082 aa  49.3  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0887  hypothetical protein  41.43 
 
 		 423 aa  47.8  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  26.98 
 
 		 321 aa  45.1  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  27.56 
 
 		 651 aa  45.1  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  27.54 
 
 		 328 aa  44.7  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1789  multiheme cytochrome  31.01 
 
 		 280 aa  44.7  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0570598 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  24.87 
 
 		 462 aa  44.7  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>