103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3544 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  92.7 
 
 		 1110 aa  2118    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  41.23 
 
 		 1294 aa  795    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  100 
 
 		 1106 aa  2273    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  41.22 
 
 		 812 aa  494  9.999999999999999e-139  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  46.92 
 
 		 902 aa  341  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  49.53 
 
 		 1009 aa  337  7e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  46.06 
 
 		 1018 aa  332  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  46.64 
 
 		 1017 aa  330  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  42.47 
 
 		 1038 aa  292  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  42.51 
 
 		 1017 aa  292  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  42.21 
 
 		 957 aa  283  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  37.58 
 
 		 955 aa  264  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  41.71 
 
 		 958 aa  260  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  41.71 
 
 		 958 aa  260  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  37.03 
 
 		 1036 aa  248  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  37.44 
 
 		 1046 aa  239  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  37.32 
 
 		 1053 aa  214  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3156  hypothetical protein  37.06 
 
 		 946 aa  214  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0891  hypothetical protein  32.3 
 
 		 554 aa  210  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93749e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0994  hypothetical protein  36.04 
 
 		 534 aa  198  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  36.98 
 
 		 1143 aa  167  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3284  hypothetical protein  29.64 
 
 		 593 aa  164  9e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000750415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0989  hypothetical protein  30.77 
 
 		 595 aa  160  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00830032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  39.22 
 
 		 1143 aa  154  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3354  hypothetical protein  29.43 
 
 		 611 aa  154  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00026659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  29.15 
 
 		 1457 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2737  polyheme membrane-associated cytochrome c  30.79 
 
 		 744 aa  138  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  29.43 
 
 		 768 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  29.87 
 
 		 1601 aa  133  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2295  hypothetical protein  28.01 
 
 		 500 aa  132  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  28.67 
 
 		 490 aa  129  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  29.95 
 
 		 783 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  29.95 
 
 		 789 aa  112  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  37.89 
 
 		 1281 aa  103  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  28.08 
 
 		 1611 aa  66.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  26.73 
 
 		 867 aa  63.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  25.53 
 
 		 328 aa  61.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1524  cytochrome c family protein  28 
 
 		 333 aa  60.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.462693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  31.85 
 
 		 1314 aa  59.7  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  26.1 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  27 
 
 		 916 aa  58.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  23.96 
 
 		 1538 aa  58.2  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  24.71 
 
 		 299 aa  57  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  26.46 
 
 		 326 aa  56.6  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2677  cytochrome C family protein  25.48 
 
 		 329 aa  56.2  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.376662  normal  0.0163011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  26.08 
 
 		 1537 aa  55.8  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2511  cytochrome C family protein  25.28 
 
 		 329 aa  55.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.115309  hitchhiker  0.00672893 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  25.68 
 
 		 333 aa  55.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  27.83 
 
 		 333 aa  55.1  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1577  cytochrome C family protein  27.83 
 
 		 333 aa  55.1  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000354628  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1611  cytochrome C family protein  27.83 
 
 		 333 aa  55.1  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.173927  normal  0.248798 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2766  cytochrome C family protein  27.83 
 
 		 333 aa  55.1  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  hitchhiker  0.000000422231 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1777  decaheme cytochrome c MtrA  25.34 
 
 		 333 aa  54.7  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  26.57 
 
 		 316 aa  54.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  28.57 
 
 		 656 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  32.86 
 
 		 2082 aa  53.5  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2579  cytochrome C family protein  27.17 
 
 		 329 aa  53.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.069167  normal  0.0206665 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1477  cytochrome C family protein  28.42 
 
 		 334 aa  53.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000779097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  25.15 
 
 		 321 aa  53.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  27.13 
 
 		 329 aa  51.6  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  27.67 
 
 		 650 aa  51.6  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  25.6 
 
 		 655 aa  51.6  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0676  multihaem cytochrome  29.73 
 
 		 359 aa  51.6  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2574  cytochrome C family protein  24.83 
 
 		 321 aa  50.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.448859  hitchhiker  0.00699839 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  27.33 
 
 		 650 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  31.25 
 
 		 1521 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2506  cytochrome C family protein  24.83 
 
 		 321 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.365224  hitchhiker  0.00105775 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2672  cytochrome C family protein  24.5 
 
 		 321 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.655979  normal  0.0486911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  23.94 
 
 		 901 aa  50.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  26.02 
 
 		 309 aa  50.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  22.19 
 
 		 340 aa  50.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  23.8 
 
 		 306 aa  50.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  24.7 
 
 		 314 aa  49.7  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  30 
 
 		 1691 aa  50.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  22.25 
 
 		 658 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  25.15 
 
 		 321 aa  49.7  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0689  multiheme cytochrome  29.05 
 
 		 359 aa  49.7  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000324131 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0615  cytochrome c family protein  28.07 
 
 		 362 aa  49.3  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.131648  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  25.65 
 
 		 314 aa  49.3  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1024 aa  49.3  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  28.93 
 
 		 1672 aa  48.5  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2519  cytochrome C family protein  25.08 
 
 		 322 aa  48.5  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.589751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  28.1 
 
 		 1596 aa  48.5  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  24.85 
 
 		 319 aa  48.1  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  23.85 
 
 		 321 aa  48.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  28.92 
 
 		 1482 aa  48.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1402  cytochrome c family protein  25.46 
 
 		 316 aa  47.4  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  25.98 
 
 		 319 aa  48.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  25.58 
 
 		 436 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  25.58 
 
 		 436 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  25.19 
 
 		 315 aa  47  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  24.85 
 
 		 321 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  24.54 
 
 		 304 aa  47  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  25 
 
 		 656 aa  47  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  22.83 
 
 		 1196 aa  47  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  24.59 
 
 		 480 aa  46.2  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2899  cytochrome c family protein  26.1 
 
 		 374 aa  46.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.167025  normal  0.604733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  25.63 
 
 		 317 aa  46.2  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  24.51 
 
 		 600 aa  45.8  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0580  cytochrome c family protein  24.46 
 
 		 252 aa  45.4  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>