18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3354 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0891  hypothetical protein  55.3 
 
 		 554 aa  639    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93749e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3354  hypothetical protein  100 
 
 		 611 aa  1258    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00026659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3284  hypothetical protein  50 
 
 		 593 aa  568  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000750415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  36.13 
 
 		 490 aa  266  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0994  hypothetical protein  33.88 
 
 		 534 aa  233  1e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2737  polyheme membrane-associated cytochrome c  31.36 
 
 		 744 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2295  hypothetical protein  31.26 
 
 		 500 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  31.73 
 
 		 812 aa  193  9e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0989  hypothetical protein  30.64 
 
 		 595 aa  190  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00830032  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  34.9 
 
 		 768 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  32.7 
 
 		 1294 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  29.66 
 
 		 1110 aa  158  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  30 
 
 		 1106 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  27.54 
 
 		 1601 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3156  hypothetical protein  31.63 
 
 		 946 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  26.94 
 
 		 789 aa  101  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  24.88 
 
 		 783 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  22.12 
 
 		 867 aa  48.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.887369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>