20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0891 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0891  hypothetical protein  100 
 
 
554 aa  1142    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93749e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3354  hypothetical protein  55.3 
 
 
611 aa  628  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00026659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3284  hypothetical protein  49.91 
 
 
593 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000750415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0994  hypothetical protein  34 
 
 
534 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2295  hypothetical protein  33.52 
 
 
500 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  34.51 
 
 
490 aa  234  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  31.84 
 
 
812 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  32.5 
 
 
1106 aa  213  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0989  hypothetical protein  30.32 
 
 
595 aa  208  2e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00830032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  32.83 
 
 
1110 aa  208  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  34.55 
 
 
1294 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  34.45 
 
 
768 aa  189  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2737  polyheme membrane-associated cytochrome c  29.77 
 
 
744 aa  179  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  30.25 
 
 
1601 aa  156  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3156  hypothetical protein  26.39 
 
 
946 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  25.8 
 
 
789 aa  106  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  25.42 
 
 
783 aa  99  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  23.81 
 
 
916 aa  52.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  25.13 
 
 
867 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  28.05 
 
 
446 aa  43.5  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>