19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3156 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3156  hypothetical protein  100 
 
 		 946 aa  1923    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  31.7 
 
 		 789 aa  234  6e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  30.06 
 
 		 783 aa  228  5.0000000000000005e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  33.27 
 
 		 1110 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2737  polyheme membrane-associated cytochrome c  35.36 
 
 		 744 aa  213  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  37.17 
 
 		 1106 aa  202  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  36.53 
 
 		 812 aa  201  3.9999999999999996e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  35.39 
 
 		 768 aa  201  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  33.42 
 
 		 490 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0994  hypothetical protein  31.2 
 
 		 534 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2295  hypothetical protein  30.53 
 
 		 500 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0891  hypothetical protein  26.82 
 
 		 554 aa  125  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93749e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3354  hypothetical protein  31.63 
 
 		 611 aa  119  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00026659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3284  hypothetical protein  29.63 
 
 		 593 aa  102  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000750415  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  26.9 
 
 		 1601 aa  90.5  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0989  hypothetical protein  24.81 
 
 		 595 aa  82.8  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00830032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1294 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  22.06 
 
 		 867 aa  51.6  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  27.43 
 
 		 1314 aa  45.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>