51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0101 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0101  hypothetical protein  100 
 
 		 1314 aa  2623    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.470357 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  45.58 
 
 		 1024 aa  329  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  40.64 
 
 		 1189 aa  161  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2132  hypothetical protein  43.32 
 
 		 646 aa  157  1e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2918  hypothetical protein  36.97 
 
 		 873 aa  136  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  30.08 
 
 		 1814 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1804  Tfp pilus assembly protein tip-associated adhesin PilY1-like protein  39.91 
 
 		 1482 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2032  hypothetical protein  29.01 
 
 		 2004 aa  107  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2849  fibronectin, type III domain-containing protein  51.11 
 
 		 489 aa  88.6  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00390509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2884  hypothetical protein  29.5 
 
 		 1017 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  37.66 
 
 		 2082 aa  83.2  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1944  hypothetical protein  53.33 
 
 		 679 aa  82.4  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.540087  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3268  hypothetical protein  29.11 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0103  hypothetical protein  40.52 
 
 		 684 aa  75.5  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2923  cell wall surface anchor family protein  24.38 
 
 		 746 aa  74.3  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  29.62 
 
 		 1667 aa  73.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1080  Fibronectin type III domain protein  54.55 
 
 		 518 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1994  hypothetical protein  28.16 
 
 		 1321 aa  68.6  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311677  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1642  hypothetical protein  41.18 
 
 		 717 aa  68.2  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  28.28 
 
 		 1236 aa  67.8  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  31 
 
 		 1367 aa  67  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  31.58 
 
 		 2713 aa  64.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0117  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.5 
 
 		 1336 aa  64.7  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.750055  normal  0.74938 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  34.76 
 
 		 1601 aa  63.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  31.87 
 
 		 1106 aa  59.3  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  31.61 
 
 		 1110 aa  59.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2700  hypothetical protein  32.97 
 
 		 286 aa  56.6  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.620898 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  36.36 
 
 		 607 aa  55.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3181  Fibronectin type III domain protein  53.03 
 
 		 524 aa  54.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3132  conserved repeat domain protein  38.95 
 
 		 5517 aa  53.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.593801 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1444  extracellular solute-binding protein  41.1 
 
 		 1184 aa  53.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.913527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  32.81 
 
 		 2656 aa  52.8  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0739  YSIRK Gram-positive signal peptide  23.62 
 
 		 2035 aa  52.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2421  conserved repeat domain protein  36.84 
 
 		 3373 aa  52.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  36.14 
 
 		 5544 aa  52.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3535  Carbonate dehydratase  37.8 
 
 		 440 aa  50.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0570  conserved repeat domain protein  34.21 
 
 		 2047 aa  50.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  39.06 
 
 		 2176 aa  50.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1649  Cna B domain-containing protein  36.99 
 
 		 2990 aa  49.7  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1068  hypothetical protein  37.33 
 
 		 5166 aa  49.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0052  hypothetical protein  29.27 
 
 		 295 aa  48.5  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0321286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3498  Cna B-type  30.65 
 
 		 1531 aa  48.5  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.149942  normal  0.725774 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1229  hypothetical protein  24.74 
 
 		 857 aa  47.8  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.627045  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0105  Parallel beta-helix repeat protein  31.73 
 
 		 609 aa  47.8  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.28403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2197  hypothetical protein  35.06 
 
 		 5203 aa  47  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3021  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  45.31 
 
 		 722 aa  47  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105291 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1781  hypothetical protein  36.62 
 
 		 724 aa  45.8  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0929  Cna B domain-containing protein  28.87 
 
 		 2876 aa  46.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.213129 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2384  hypothetical protein  32.39 
 
 		 155 aa  45.4  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.043674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3156  hypothetical protein  27.32 
 
 		 946 aa  45.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3048  Cna B-type  27.04 
 
 		 733 aa  45.1  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.938472  normal  0.0115625 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>