21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2295 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2295  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  1036    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0989  hypothetical protein  40.49 
 
 		 595 aa  323  3e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00830032  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  38.81 
 
 		 490 aa  280  5e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0994  hypothetical protein  34.68 
 
 		 534 aa  233  8.000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0891  hypothetical protein  32.96 
 
 		 554 aa  229  6e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93749e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3284  hypothetical protein  33.52 
 
 		 593 aa  211  3e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000750415  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3354  hypothetical protein  31.7 
 
 		 611 aa  190  4e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00026659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2737  polyheme membrane-associated cytochrome c  32.24 
 
 		 744 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  33.87 
 
 		 768 aa  162  2e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  29.22 
 
 		 812 aa  147  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  28.24 
 
 		 1110 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3156  hypothetical protein  30.53 
 
 		 946 aa  134  6e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  28.01 
 
 		 1106 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  30.06 
 
 		 1294 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1601 aa  120  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  36.32 
 
 		 783 aa  107  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  43.17 
 
 		 789 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  26.67 
 
 		 867 aa  60.5  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  28.37 
 
 		 916 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  22.4 
 
 		 802 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  22.48 
 
 		 758 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>