25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0913 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  100 
 
 		 490 aa  1011    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2295  hypothetical protein  38.12 
 
 		 500 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3354  hypothetical protein  36.21 
 
 		 611 aa  265  2e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00026659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3284  hypothetical protein  35.01 
 
 		 593 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000750415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0891  hypothetical protein  34.22 
 
 		 554 aa  231  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93749e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0994  hypothetical protein  31.37 
 
 		 534 aa  161  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2737  polyheme membrane-associated cytochrome c  33.16 
 
 		 744 aa  157  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3156  hypothetical protein  33.42 
 
 		 946 aa  155  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  35.88 
 
 		 768 aa  153  7e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  30.5 
 
 		 1110 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0989  hypothetical protein  28.23 
 
 		 595 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00830032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  29.84 
 
 		 1294 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  28.67 
 
 		 1106 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  29.6 
 
 		 812 aa  126  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  27.2 
 
 		 1601 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  24.47 
 
 		 789 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  25.99 
 
 		 916 aa  68.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  26.27 
 
 		 783 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  22.06 
 
 		 867 aa  50.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  23.94 
 
 		 658 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0703  hypothetical protein  24.37 
 
 		 690 aa  45.8  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00189573  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  26.98 
 
 		 505 aa  45.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  28.28 
 
 		 144 aa  44.7  0.004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1871  tRNA synthetase, class II  23.59 
 
 		 688 aa  43.9  0.007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  23.08 
 
 		 471 aa  43.5  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>