70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2739 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  973    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  31.67 
 
 		 346 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  32.47 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  32.47 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  32.47 
 
 		 346 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  27 
 
 		 350 aa  92.4  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0689  multiheme cytochrome  22.49 
 
 		 359 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000324131 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0676  multihaem cytochrome  23.04 
 
 		 359 aa  90.9  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1577  cytochrome c family protein  23.18 
 
 		 372 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0594  cytochrome c family protein  25.34 
 
 		 349 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  27.72 
 
 		 658 aa  89  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  34.15 
 
 		 688 aa  80.1  0.00000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2712  hypothetical protein  24.06 
 
 		 366 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  26.44 
 
 		 729 aa  72.4  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  27.98 
 
 		 670 aa  67.8  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  26.21 
 
 		 615 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  25.42 
 
 		 757 aa  66.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  26.46 
 
 		 618 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  27.55 
 
 		 619 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  25.11 
 
 		 689 aa  62.8  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  25.25 
 
 		 662 aa  62.4  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  28.34 
 
 		 655 aa  58.9  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  26.53 
 
 		 618 aa  59.3  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  23.28 
 
 		 577 aa  53.9  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  27.32 
 
 		 616 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  24.34 
 
 		 540 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  27.01 
 
 		 616 aa  52.4  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  25.84 
 
 		 688 aa  52  0.00003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  26.86 
 
 		 426 aa  51.6  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  26.19 
 
 		 658 aa  50.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2759  cytochrome C family protein  24.66 
 
 		 449 aa  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  25.67 
 
 		 413 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  28.03 
 
 		 211 aa  49.7  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  24.89 
 
 		 577 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  28.15 
 
 		 778 aa  48.1  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  27.33 
 
 		 656 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  26.67 
 
 		 316 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  29.01 
 
 		 314 aa  48.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  28.34 
 
 		 312 aa  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  25.42 
 
 		 436 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  25.56 
 
 		 650 aa  47.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  29.59 
 
 		 309 aa  47  0.0007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  28.74 
 
 		 270 aa  47  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  30.25 
 
 		 315 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  23.97 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  23.76 
 
 		 429 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  29.17 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  25.42 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  27.55 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  31.87 
 
 		 270 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  25.42 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  30 
 
 		 266 aa  45.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  26.09 
 
 		 566 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0260  hypothetical protein  24.67 
 
 		 212 aa  45.8  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2381  hypothetical protein  26.49 
 
 		 270 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  22.01 
 
 		 321 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  23.51 
 
 		 321 aa  45.1  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  25.1 
 
 		 571 aa  44.7  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  23.13 
 
 		 321 aa  44.7  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  25.69 
 
 		 566 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2526  cytochrome C family protein  26.77 
 
 		 329 aa  43.9  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2898  cytochrome c family protein  25 
 
 		 330 aa  43.9  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.808902  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  26.19 
 
 		 453 aa  43.9  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  25.76 
 
 		 326 aa  43.9  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2494  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 434 aa  43.9  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2045  hypothetical protein  27.92 
 
 		 209 aa  43.5  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00025846  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  21.64 
 
 		 319 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1782  decaheme cytochrome c MtrD  22.81 
 
 		 306 aa  43.5  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  22.22 
 
 		 490 aa  43.5  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  27.38 
 
 		 318 aa  43.1  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>