23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1871 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0482  cytochrome c, putative  50.45 
 
 		 678 aa  660    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0703  hypothetical protein  75.36 
 
 		 690 aa  1138    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00189573  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4477  cytochrome c, putative  49.93 
 
 		 678 aa  662    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4456  cytochrome c, putative  51.52 
 
 		 676 aa  688    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4002  cytochrome c, putative  52.49 
 
 		 687 aa  691    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0503  cytochrome c, putative  52.12 
 
 		 676 aa  694    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0479  cytochrome c, putative  50.43 
 
 		 678 aa  664    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0493  cytochrome c, putative  51.74 
 
 		 676 aa  695    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0479  cytochrome c, putative  51.69 
 
 		 709 aa  685    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1871  tRNA synthetase, class II  100 
 
 		 688 aa  1455    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3877  cytochrome c, putative  51.1 
 
 		 709 aa  673    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.845575  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3364  cytochrome c, putative  50.96 
 
 		 709 aa  674    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0348  cytochrome c, putative  52.04 
 
 		 679 aa  712    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0489  cytochrome c, putative  50.21 
 
 		 709 aa  678    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3542  cytochrome c, putative  51.54 
 
 		 709 aa  676    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0488  cytochrome c, putative  51.69 
 
 		 709 aa  677    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  48.9 
 
 		 652 aa  602  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  48.75 
 
 		 650 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2963  cytochrome c, putative  48.43 
 
 		 656 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364995  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  45.96 
 
 		 656 aa  594  1e-168  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0806  cytochrome c family protein  47.74 
 
 		 645 aa  569  1e-161  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  44.15 
 
 		 664 aa  560  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  24.22 
 
 		 1106 aa  44.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>