60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1830 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1830  flavocytochrome c heme subunit  100 
 
 
144 aa  297  3e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2085  flavocytochrome c heme subunit  53.62 
 
 
146 aa  158  2e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.952774  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1445  flavocytochrome c heme subunit  49.62 
 
 
153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.390446  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0137  fumarate reductase flavoprotein subunit  36.23 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100425  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1491  tetraheme cytochrome c  40.66 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3056  tetraheme cytochrome c  38.46 
 
 
127 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2229  tetraheme cytochrome c  35 
 
 
117 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2430  tetraheme cytochrome c  30.99 
 
 
135 aa  55.1  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.439789  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3535  tetraheme cytochrome c  34.07 
 
 
119 aa  53.9  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3896  tetraheme cytochrome c  34.26 
 
 
117 aa  54.3  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.486536  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2152  tetraheme cytochrome c  35 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.738839  normal  0.0741814 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0276  tetraheme cytochrome c  34.65 
 
 
117 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000156346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3370  tetraheme cytochrome c  36.45 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.656549  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0342  tetraheme cytochrome c  34.51 
 
 
126 aa  52.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3938  tetraheme cytochrome c  34.29 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0257  tetraheme cytochrome c  37.21 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0274  tetraheme cytochrome c  34.62 
 
 
117 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010475 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2510  tetraheme cytochrome c  33.04 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2279  tetraheme cytochrome c  32.71 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0855381  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2535  tetraheme cytochrome c, putative  27.07 
 
 
122 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.091656  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04270  hypothetical protein  26.88 
 
 
182 aa  51.2  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.379993  normal  0.356103 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0255  tetraheme cytochrome c  36.46 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2402  tetraheme cytochrome c, putative  25.98 
 
 
122 aa  48.5  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3623  tetraheme cytochrome c  34.85 
 
 
116 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1004  hypothetical protein  34.26 
 
 
165 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3693  hypothetical protein  33.71 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.799168  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4185  tetraheme cytochrome c, putative  30.21 
 
 
122 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.17754 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0946  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  37.36 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4179  tetraheme cytochrome c  32.67 
 
 
120 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.717177 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0339  cytochrome c  31.19 
 
 
116 aa  47  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1158  hypothetical protein  34.09 
 
 
114 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0275  tetraheme cytochrome c, putative  28.57 
 
 
122 aa  47  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173309 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0509  tetraheme cytochrome c  33.7 
 
 
118 aa  47  0.00009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0942  hypothetical protein  28.1 
 
 
172 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0324  tetraheme cytochrome c, putative  30.21 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  31.13 
 
 
589 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3617  hypothetical protein  31.87 
 
 
137 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3683  hypothetical protein  31.87 
 
 
137 aa  45.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1413  tetraheme cytochrome c, putative  27.78 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0300  tetraheme cytochrome c, putative  27.78 
 
 
123 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.42786  normal  0.0669072 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  29.63 
 
 
596 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  38.71 
 
 
588 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2786  hypothetical protein  32.91 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  29.63 
 
 
596 aa  44.3  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  28.28 
 
 
490 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0588  hypothetical protein  29.14 
 
 
607 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221838  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  28.4 
 
 
596 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3388  hypothetical protein  33.77 
 
 
116 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.57 
 
 
593 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3300  cytochrome c  37.1 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  31.4 
 
 
596 aa  41.6  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  25 
 
 
596 aa  41.2  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3769  hypothetical protein  32.95 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0887  hypothetical protein  30.84 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.590211  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2585  hypothetical protein  36.99 
 
 
232 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000203897  normal  0.20088 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2892  hypothetical protein  43.75 
 
 
122 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3182  hypothetical protein  30.95 
 
 
118 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  31.76 
 
 
591 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  25 
 
 
784 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  31.65 
 
 
596 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>