26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0703 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_0482  cytochrome c, putative  49.86 
 
 
678 aa  688    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0703  hypothetical protein  100 
 
 
690 aa  1457    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00189573  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4477  cytochrome c, putative  51.01 
 
 
678 aa  695    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4456  cytochrome c, putative  51.52 
 
 
676 aa  734    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4002  cytochrome c, putative  50.93 
 
 
687 aa  707    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0503  cytochrome c, putative  52.1 
 
 
676 aa  742    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0479  cytochrome c, putative  51.29 
 
 
678 aa  694    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0493  cytochrome c, putative  52.02 
 
 
676 aa  735    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0479  cytochrome c, putative  49.72 
 
 
709 aa  703    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1871  tRNA synthetase, class II  75.36 
 
 
688 aa  1138    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3877  cytochrome c, putative  49.51 
 
 
709 aa  693    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.845575  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3364  cytochrome c, putative  49.44 
 
 
709 aa  697    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0348  cytochrome c, putative  53.68 
 
 
679 aa  759    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0489  cytochrome c, putative  49.93 
 
 
709 aa  704    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3542  cytochrome c, putative  49.86 
 
 
709 aa  702    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0488  cytochrome c, putative  50 
 
 
709 aa  703    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3159  cytochrome c, putative  50.16 
 
 
652 aa  628  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2963  cytochrome c, putative  50 
 
 
656 aa  625  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364995  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3051  cytochrome c, putative  50 
 
 
650 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.315453  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  49.14 
 
 
656 aa  620  1e-176  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0806  cytochrome c family protein  48.75 
 
 
645 aa  597  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.733591  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  45.47 
 
 
664 aa  588  1e-166  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  23.64 
 
 
556 aa  53.9  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  24.51 
 
 
563 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  24.49 
 
 
490 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  25.36 
 
 
458 aa  45.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>