38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6274 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  100 
 
 
867 aa  1766    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0994  hypothetical protein  25.19 
 
 
534 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2737  polyheme membrane-associated cytochrome c  27.25 
 
 
744 aa  78.6  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  24.22 
 
 
768 aa  71.6  0.00000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  23.95 
 
 
812 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0080  Ig-like domain-containing protein  33.12 
 
 
220 aa  69.7  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  28.11 
 
 
1110 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0989  hypothetical protein  25.44 
 
 
595 aa  67.8  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00830032  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  26.73 
 
 
1106 aa  63.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  24.19 
 
 
1294 aa  60.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2295  hypothetical protein  26.67 
 
 
500 aa  60.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2428  Ig domain-containing protein  34.19 
 
 
466 aa  58.9  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.177832  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  34.71 
 
 
4630 aa  56.2  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1738  Ig domain-containing protein  34.78 
 
 
316 aa  55.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.369311 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3156  hypothetical protein  22.06 
 
 
946 aa  51.6  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  34.94 
 
 
1009 aa  51.6  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  30.73 
 
 
916 aa  51.6  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2500  Ig domain-containing protein  36.22 
 
 
1300 aa  51.6  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1213  Ig domain-containing protein  29.41 
 
 
1361 aa  51.2  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.406135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2618  Ig domain-containing protein  26 
 
 
399 aa  50.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000153391  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  21.73 
 
 
1601 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3203  Ig domain-containing protein  25.16 
 
 
981 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3003  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.47 
 
 
752 aa  49.7  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000481443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  22.06 
 
 
490 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0685  Ig domain protein group 2 domain protein  33.83 
 
 
437 aa  50.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0371  Ig domain-containing protein  27.27 
 
 
472 aa  48.9  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  25.95 
 
 
1831 aa  48.9  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  21.57 
 
 
789 aa  47.8  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  37.59 
 
 
2042 aa  47.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  22.8 
 
 
783 aa  47.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3354  hypothetical protein  22.12 
 
 
611 aa  47  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00026659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0891  hypothetical protein  25.27 
 
 
554 aa  46.2  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93749e-28 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4476  Ig domain protein group 2 domain protein  27.37 
 
 
570 aa  46.6  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2125  Ig domain-containing protein  26.62 
 
 
472 aa  47  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1301  glycosyl hydrolase family 31 protein  31.68 
 
 
1965 aa  46.6  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.449133  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1212  Ig domain-containing protein  32.35 
 
 
1279 aa  46.2  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18640  calcineurin-like phosphoesterase  29.81 
 
 
1732 aa  45.8  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2672  glycosy hydrolase family protein  36.14 
 
 
1193 aa  45.8  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>