22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0989 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0989  hypothetical protein  100 
 
 
595 aa  1232    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00830032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  40.89 
 
 
1601 aa  332  2e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2295  hypothetical protein  40.49 
 
 
500 aa  323  4e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0994  hypothetical protein  36.53 
 
 
534 aa  291  2e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3284  hypothetical protein  30.56 
 
 
593 aa  206  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000750415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0891  hypothetical protein  29.63 
 
 
554 aa  205  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93749e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3354  hypothetical protein  31.49 
 
 
611 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00026659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  30.88 
 
 
1110 aa  167  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  30.77 
 
 
1106 aa  160  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  27.99 
 
 
1294 aa  159  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  29.19 
 
 
812 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  58.73 
 
 
789 aa  144  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  59.66 
 
 
783 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2737  polyheme membrane-associated cytochrome c  30.94 
 
 
744 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  28.16 
 
 
490 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  29.08 
 
 
768 aa  124  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3156  hypothetical protein  24.81 
 
 
946 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  25.44 
 
 
867 aa  67.8  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  24.25 
 
 
916 aa  53.5  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  24.51 
 
 
758 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  24.86 
 
 
259 aa  51.2  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 
687 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>