56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3991 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3991  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 687 aa  1358    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3059  TPR repeat-containing protein  44.78 
 
 		 771 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1988  TPR repeat-containing protein  45.4 
 
 		 764 aa  531  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.645033 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  41.97 
 
 		 784 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3109  hypothetical protein  42.09 
 
 		 649 aa  441  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  41.3 
 
 		 781 aa  435  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1945  TPR repeat-containing protein  39.44 
 
 		 828 aa  428  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3872  cytochrome C family protein  41.12 
 
 		 742 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.817906  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3904  TPR domain-containing protein  42.81 
 
 		 755 aa  413  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.041716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0602  hypothetical protein  38.02 
 
 		 817 aa  405  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  39.52 
 
 		 773 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6906  cytochrome C family protein  39.11 
 
 		 758 aa  405  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.361368 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2378  TPR domain-containing protein  34.38 
 
 		 743 aa  402  9.999999999999999e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0783  hypothetical protein  33.96 
 
 		 651 aa  381  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5770  TPR repeat-containing protein  37.52 
 
 		 764 aa  382  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0786479  normal  0.562645 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1237  TPR repeat-containing protein  37.7 
 
 		 802 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.200313 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003600  TPR domain protein  33.69 
 
 		 708 aa  358  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2987  TPR domain-containing protein  29.2 
 
 		 778 aa  337  5.999999999999999e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3652  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 		 729 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0372176  normal  0.0239407 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1449  tetratricopeptide TPR_2  28.41 
 
 		 799 aa  296  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0379  cytochrome C family protein  31.37 
 
 		 767 aa  261  2e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.295116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2521  hypothetical protein  27.27 
 
 		 640 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0100183  normal  0.93164 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1803  hypothetical protein  25.47 
 
 		 394 aa  94.4  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3498  hypothetical protein  26.02 
 
 		 391 aa  86.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1942  hypothetical protein  25.86 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.253838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2292  hypothetical protein  23.49 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0100786 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0313  hypothetical protein  25.38 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  28.63 
 
 		 563 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2854  TPR repeat-containing protein  22.59 
 
 		 654 aa  62.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000521084 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3262  hypothetical protein  19.84 
 
 		 453 aa  61.6  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.931902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2918  hypothetical protein  24.65 
 
 		 469 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  22.13 
 
 		 556 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0594  hypothetical protein  18.27 
 
 		 403 aa  57.4  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.405958  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3259  hypothetical protein  22.33 
 
 		 536 aa  56.2  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2507  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 351 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2664  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 537 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0989  hypothetical protein  23.78 
 
 		 595 aa  53.5  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00830032  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  22.62 
 
 		 516 aa  50.8  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0015  hypothetical protein  22.16 
 
 		 664 aa  50.4  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0993  cytochrome C family protein  21.86 
 
 		 595 aa  49.7  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2770  hypothetical protein  23.23 
 
 		 519 aa  49.7  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2445  TPR repeat-containing protein  32.21 
 
 		 351 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0758357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1841  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.48 
 
 		 1343 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.520685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2334  TPR repeat-containing protein  31.85 
 
 		 399 aa  48.5  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.752324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0063  hypothetical protein  21.34 
 
 		 656 aa  47.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1625  hypothetical protein  23.99 
 
 		 386 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  23.94 
 
 		 539 aa  47  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2711  cytochrome c family protein  35.48 
 
 		 156 aa  46.2  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 714 aa  45.4  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3248  hypothetical protein  25.82 
 
 		 697 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  33.9 
 
 		 714 aa  45.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 505 aa  44.7  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  27.17 
 
 		 259 aa  44.3  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  37.63 
 
 		 502 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  36.73 
 
 		 502 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 		 502 aa  44.3  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>