28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2737 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2737  polyheme membrane-associated cytochrome c  100 
 
 		 744 aa  1521    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  67.56 
 
 		 768 aa  983    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  39.7 
 
 		 783 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  38.38 
 
 		 789 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3156  hypothetical protein  31.29 
 
 		 946 aa  273  9e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0994  hypothetical protein  37.69 
 
 		 534 aa  206  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3354  hypothetical protein  31.36 
 
 		 611 aa  204  6e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00026659  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  35.31 
 
 		 812 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0891  hypothetical protein  29.64 
 
 		 554 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93749e-28 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2295  hypothetical protein  32.24 
 
 		 500 aa  170  8e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3284  hypothetical protein  28.17 
 
 		 593 aa  165  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000750415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  30.85 
 
 		 490 aa  160  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  29.65 
 
 		 1106 aa  146  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  30.4 
 
 		 1110 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0989  hypothetical protein  30.94 
 
 		 595 aa  132  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00830032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  27.41 
 
 		 1601 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  29.14 
 
 		 1294 aa  122  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  27.25 
 
 		 867 aa  81.3  0.00000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  26.73 
 
 		 259 aa  48.9  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1616  cytochrome C family protein  27.19 
 
 		 321 aa  47.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.093642  normal  0.713619 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3110  hypothetical protein  34.13 
 
 		 916 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  25.19 
 
 		 317 aa  45.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1582  cytochrome C family protein  26.27 
 
 		 321 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000911408  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  26.27 
 
 		 321 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  25.93 
 
 		 319 aa  45.1  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1588  cytochrome C family protein  26.74 
 
 		 333 aa  45.1  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00373932  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1207  decaheme cytochrome c MtrA  25.27 
 
 		 326 aa  44.3  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0298799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  25.19 
 
 		 317 aa  44.3  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>