22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2731 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2731  polyheme membrane-associated cytochrome c  100 
 
 		 768 aa  1583    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.209433  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2737  polyheme membrane-associated cytochrome c  67.82 
 
 		 744 aa  970    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0867  polyheme membrane-associated cytochrome c  37.28 
 
 		 783 aa  442  1e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3379  polyheme membrane-associated cytochrome c  36.92 
 
 		 789 aa  428  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.675442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3156  hypothetical protein  30.46 
 
 		 946 aa  250  9e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0994  hypothetical protein  34.22 
 
 		 534 aa  200  7e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3154  hypothetical protein  34.73 
 
 		 812 aa  196  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0891  hypothetical protein  34.9 
 
 		 554 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93749e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3354  hypothetical protein  34.38 
 
 		 611 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00026659  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2295  hypothetical protein  33.87 
 
 		 500 aa  161  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  34.2 
 
 		 490 aa  153  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3284  hypothetical protein  29.8 
 
 		 593 aa  151  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000750415  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  29.43 
 
 		 1106 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  29.92 
 
 		 1110 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0989  hypothetical protein  29.08 
 
 		 595 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00830032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1294 aa  124  5e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1601 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6274  Ig domain protein group 2 domain protein  24.22 
 
 		 867 aa  75.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.887369 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  30.07 
 
 		 266 aa  54.7  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2203  cytochrome c family protein  27.15 
 
 		 363 aa  53.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  31.06 
 
 		 266 aa  51.6  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  26.12 
 
 		 270 aa  48.9  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>