46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0059 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  100 
 
 		 505 aa  1056    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  60.78 
 
 		 489 aa  624  1e-177  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  48.49 
 
 		 488 aa  464  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  47.53 
 
 		 488 aa  463  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1764  hypothetical protein  46.71 
 
 		 535 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2076  hypothetical protein  46.62 
 
 		 529 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.616227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2170  hypothetical protein  46.83 
 
 		 528 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  42.7 
 
 		 487 aa  385  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  38.82 
 
 		 461 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  37.21 
 
 		 463 aa  317  4e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  36.81 
 
 		 473 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  39.49 
 
 		 464 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  35.23 
 
 		 456 aa  269  8.999999999999999e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  36.34 
 
 		 461 aa  268  2e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  33.33 
 
 		 455 aa  258  1e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  29.83 
 
 		 511 aa  194  2e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0217  hydroxylamine oxidase  29.94 
 
 		 520 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1248  hydroxylamine oxidase  28.14 
 
 		 496 aa  176  9e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  32.04 
 
 		 447 aa  158  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  32.04 
 
 		 446 aa  156  7e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  30.43 
 
 		 442 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  29.27 
 
 		 417 aa  143  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  28.21 
 
 		 413 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  29.68 
 
 		 407 aa  126  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1044  hypothetical protein  26.42 
 
 		 418 aa  111  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000096075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  24.58 
 
 		 425 aa  92.8  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  25 
 
 		 436 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2662  hydroxylamine oxidase  24.43 
 
 		 570 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000630744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1082  hydroxylamine oxidase  24.43 
 
 		 570 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00172641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0805  hydroxylamine oxidase  24.43 
 
 		 570 aa  84.7  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0892  hydroxylamine oxidase  25.33 
 
 		 580 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0707349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0956  hydroxylamine oxydoreductase  37.96 
 
 		 559 aa  79.7  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1402  double CXXCH motif-containing protein  26.55 
 
 		 317 aa  50.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0638375 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2925  cytochrome c family protein  26.96 
 
 		 315 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  26.14 
 
 		 334 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2820  cytochrome C family protein  24.12 
 
 		 312 aa  47.8  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1601 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1461  hypothetical protein  24.66 
 
 		 709 aa  46.2  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642197  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1228  cytochrome c family protein  26.34 
 
 		 337 aa  45.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0933631  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  26.98 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3218  cytochrome c family protein  28.69 
 
 		 480 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0562793  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  30.4 
 
 		 270 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  24.88 
 
 		 307 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1144  cytochrome C family protein  25.57 
 
 		 334 aa  43.9  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  25 
 
 		 566 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2291  cytochrome C family protein  25.57 
 
 		 335 aa  43.5  0.01  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>