35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2550 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  100 
 
 		 511 aa  1067    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1248  hydroxylamine oxidase  52.79 
 
 		 496 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0217  hydroxylamine oxidase  51.77 
 
 		 520 aa  538  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  31.36 
 
 		 461 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  31.64 
 
 		 464 aa  210  6e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  29.18 
 
 		 473 aa  206  1e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  31.82 
 
 		 463 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  31.07 
 
 		 489 aa  200  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  32.58 
 
 		 488 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  31.98 
 
 		 488 aa  196  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  29.83 
 
 		 505 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  30.15 
 
 		 456 aa  192  1e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2170  hypothetical protein  30.56 
 
 		 528 aa  186  9e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2076  hypothetical protein  31.11 
 
 		 529 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.616227  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  27.66 
 
 		 487 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1764  hypothetical protein  29.24 
 
 		 535 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  27.44 
 
 		 455 aa  166  6.9999999999999995e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  27.48 
 
 		 461 aa  162  1e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  22.92 
 
 		 413 aa  97.8  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  22.48 
 
 		 417 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0956  hydroxylamine oxydoreductase  27.01 
 
 		 559 aa  85.5  0.000000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  24.05 
 
 		 447 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  24.05 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1082  hydroxylamine oxidase  26.32 
 
 		 570 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00172641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0805  hydroxylamine oxidase  26.32 
 
 		 570 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2662  hydroxylamine oxidase  26.32 
 
 		 570 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000630744  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  24.39 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  24.01 
 
 		 442 aa  77.4  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0892  hydroxylamine oxidase  28.07 
 
 		 580 aa  77.4  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0707349  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1044  hypothetical protein  21.15 
 
 		 418 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000096075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  21.38 
 
 		 425 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  23.31 
 
 		 436 aa  63.9  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  25.44 
 
 		 658 aa  50.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0533  hypothetical protein  27.63 
 
 		 222 aa  45.8  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.738429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  24.68 
 
 		 662 aa  45.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>