42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3667 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  852    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1044  hypothetical protein  61.89 
 
 		 418 aa  500  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000096075  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  55.06 
 
 		 413 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  56.46 
 
 		 442 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  54.01 
 
 		 447 aa  425  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  53.57 
 
 		 446 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  53.32 
 
 		 417 aa  422  1e-117  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  29.71 
 
 		 436 aa  179  7e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  29.93 
 
 		 425 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  28.7 
 
 		 464 aa  155  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  28.47 
 
 		 461 aa  146  6e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  27.99 
 
 		 463 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  28.8 
 
 		 473 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  27.51 
 
 		 461 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  28.24 
 
 		 455 aa  133  5e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  28.17 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  29.09 
 
 		 505 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  27.49 
 
 		 489 aa  122  9e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0956  hydroxylamine oxydoreductase  27.45 
 
 		 559 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  27 
 
 		 488 aa  119  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  26.59 
 
 		 488 aa  119  9e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0892  hydroxylamine oxidase  26.1 
 
 		 580 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0707349  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2662  hydroxylamine oxidase  27.04 
 
 		 570 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000630744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0805  hydroxylamine oxidase  27.04 
 
 		 570 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1082  hydroxylamine oxidase  27.04 
 
 		 570 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00172641  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1764  hypothetical protein  30.71 
 
 		 535 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2076  hypothetical protein  30.71 
 
 		 529 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.616227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2170  hypothetical protein  30 
 
 		 528 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  26.11 
 
 		 487 aa  93.6  6e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  24.66 
 
 		 511 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1248  hydroxylamine oxidase  28.05 
 
 		 496 aa  82  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0217  hydroxylamine oxidase  22.31 
 
 		 520 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1762  hypothetical protein  26.14 
 
 		 305 aa  50.1  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  24.78 
 
 		 566 aa  47  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  24.78 
 
 		 566 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  23.21 
 
 		 729 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  24.35 
 
 		 571 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  23.89 
 
 		 806 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  30.89 
 
 		 266 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  24.23 
 
 		 350 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  26.36 
 
 		 712 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  30.89 
 
 		 266 aa  43.9  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>