23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1762 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1762  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  637    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6394  hypothetical protein  26.82 
 
 
687 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2376  hypothetical protein  25.37 
 
 
457 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0331555  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2674  hypothetical protein  24.26 
 
 
412 aa  61.2  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0789864  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1643  cytochrome c family protein  22.92 
 
 
467 aa  61.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  24.87 
 
 
413 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2450  hypothetical protein  30.26 
 
 
408 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1683  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 
942 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.354598 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1692  hypothetical protein  22.22 
 
 
392 aa  53.5  0.000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2087  hypothetical protein  21.72 
 
 
442 aa  53.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000422239  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3059  hypothetical protein  22.35 
 
 
386 aa  50.4  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  26.14 
 
 
407 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1710  cytochrome c family protein  23.78 
 
 
490 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00235547  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  26.11 
 
 
446 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0867  cytochrome c family protein  23.31 
 
 
485 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473652  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  26.11 
 
 
447 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3444  hypothetical protein  22.22 
 
 
459 aa  47.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.166801  normal  0.529515 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0069  hypothetical protein  21.08 
 
 
434 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  25 
 
 
442 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  21.74 
 
 
417 aa  44.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0999  hypothetical protein  22.18 
 
 
368 aa  43.9  0.003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1439  hypothetical protein  34.18 
 
 
663 aa  42.7  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1754  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.44 
 
 
906 aa  42.7  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.255136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>