44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0983 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  100 
 
 
425 aa  886    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  70.83 
 
 
436 aa  635    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  30.07 
 
 
413 aa  173  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  29.58 
 
 
407 aa  170  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  26.73 
 
 
417 aa  166  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1044  hypothetical protein  28.4 
 
 
418 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000096075  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  27.73 
 
 
442 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  25.6 
 
 
447 aa  149  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  25.36 
 
 
446 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0956  hydroxylamine oxydoreductase  27.29 
 
 
559 aa  126  8.000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  24.6 
 
 
464 aa  123  7e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  25.58 
 
 
456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  26.23 
 
 
455 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  25.05 
 
 
461 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  25.44 
 
 
461 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  24.15 
 
 
473 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0805  hydroxylamine oxidase  25.12 
 
 
570 aa  110  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1082  hydroxylamine oxidase  25.12 
 
 
570 aa  110  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00172641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2662  hydroxylamine oxidase  25.12 
 
 
570 aa  110  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000630744  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  24.94 
 
 
463 aa  110  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  27.92 
 
 
488 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  26.52 
 
 
488 aa  99.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  24.58 
 
 
505 aa  92.8  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  23.73 
 
 
489 aa  92  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  24.88 
 
 
487 aa  84.7  0.000000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0892  hydroxylamine oxidase  24.09 
 
 
580 aa  81.3  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0707349  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0217  hydroxylamine oxidase  22.33 
 
 
520 aa  77  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1764  hypothetical protein  25.4 
 
 
535 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2076  hypothetical protein  25.4 
 
 
529 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.616227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2170  hypothetical protein  24.6 
 
 
528 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  21.38 
 
 
511 aa  71.2  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1248  hydroxylamine oxidase  22.46 
 
 
496 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  25 
 
 
618 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  30.73 
 
 
616 aa  47.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  27.57 
 
 
619 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  30.83 
 
 
270 aa  46.2  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  28.93 
 
 
266 aa  45.8  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  30.17 
 
 
616 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  28.72 
 
 
266 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3126  cytochrome C family protein  25 
 
 
333 aa  44.7  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00631921  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2638  cytochrome C family protein  24.77 
 
 
329 aa  43.9  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.838087  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  23.42 
 
 
317 aa  43.5  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  24.37 
 
 
618 aa  43.1  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  34.83 
 
 
270 aa  43.1  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>