33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1248 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1248  hydroxylamine oxidase  100 
 
 
496 aa  1038    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0217  hydroxylamine oxidase  53.67 
 
 
520 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  52.79 
 
 
511 aa  541  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  31.16 
 
 
463 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  30.75 
 
 
461 aa  204  2e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  31.6 
 
 
464 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  30.39 
 
 
473 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  30.74 
 
 
456 aa  191  2e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  31.06 
 
 
489 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  29.67 
 
 
461 aa  184  3e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2076  hypothetical protein  29.12 
 
 
529 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.616227  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2170  hypothetical protein  29.35 
 
 
528 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  28.14 
 
 
505 aa  176  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  29.41 
 
 
488 aa  172  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  29.22 
 
 
488 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  28.75 
 
 
455 aa  171  4e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1764  hypothetical protein  28.81 
 
 
535 aa  170  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  26.89 
 
 
487 aa  167  2.9999999999999998e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  24.4 
 
 
447 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  24.4 
 
 
446 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  24.52 
 
 
417 aa  87.8  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  24.51 
 
 
442 aa  86.7  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  22.17 
 
 
413 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  29.25 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0892  hydroxylamine oxidase  26.43 
 
 
580 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0707349  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0956  hydroxylamine oxydoreductase  24.46 
 
 
559 aa  79.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1044  hypothetical protein  30.69 
 
 
418 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000096075  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2662  hydroxylamine oxidase  25.23 
 
 
570 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000630744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1082  hydroxylamine oxidase  25.23 
 
 
570 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00172641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0805  hydroxylamine oxidase  25.23 
 
 
570 aa  75.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  22.46 
 
 
425 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  22.55 
 
 
436 aa  55.5  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  25.97 
 
 
658 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>