52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_0959 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_0953  hydroxylamine oxidase  78.37 
 
 
442 aa  666    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0956  multihaem cytochrome  97.54 
 
 
446 aa  822    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0959  multiheme cytochrome  100 
 
 
447 aa  919    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3758  hypothetical protein  63.64 
 
 
417 aa  542  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3667  hypothetical protein  53.87 
 
 
407 aa  426  1e-118  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000152326  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0142  hypothetical protein  49.88 
 
 
413 aa  425  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.611176  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1044  hypothetical protein  50.89 
 
 
418 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000096075  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0059  hypothetical protein  31.91 
 
 
505 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.811122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1628  hypothetical protein  28.78 
 
 
436 aa  162  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0434  hydroxylamine oxidase  29.2 
 
 
455 aa  159  7e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000562853  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1552  beta ketoacyl-acyl carrier protein synthase II  29.09 
 
 
456 aa  156  6e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0983  hypothetical protein  25.87 
 
 
425 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.392669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0467  hydroxylamine oxidase  28.01 
 
 
464 aa  150  6e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4755  hypothetical protein  30.17 
 
 
488 aa  145  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0308268  unclonable  0.0000000219309 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  26.71 
 
 
461 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4366  hypothetical protein  29.34 
 
 
488 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2383  hypothetical protein  29.03 
 
 
473 aa  139  1e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  27.08 
 
 
463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  26.68 
 
 
489 aa  136  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2076  hypothetical protein  28.84 
 
 
529 aa  129  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.616227  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  27.8 
 
 
461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2170  hypothetical protein  28.22 
 
 
528 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.355183  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1764  hypothetical protein  28.27 
 
 
535 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2662  hydroxylamine oxidase  26.26 
 
 
570 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000630744  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1082  hydroxylamine oxidase  26.26 
 
 
570 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00172641  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0805  hydroxylamine oxidase  26.26 
 
 
570 aa  116  7.999999999999999e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0550  hypothetical protein  27.67 
 
 
487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000169921  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0956  hydroxylamine oxydoreductase  26.72 
 
 
559 aa  114  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.157414  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0892  hydroxylamine oxidase  23.77 
 
 
580 aa  102  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0707349  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1248  hydroxylamine oxidase  24.67 
 
 
496 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0217  hydroxylamine oxidase  25.28 
 
 
520 aa  94  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  24.79 
 
 
511 aa  86.7  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1762  hypothetical protein  26.11 
 
 
305 aa  48.5  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0891  hypothetical protein  27.08 
 
 
554 aa  46.6  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93749e-28 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0615  hypothetical protein  31.65 
 
 
148 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00186832  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  25.7 
 
 
688 aa  46.6  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  25.62 
 
 
566 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  22.93 
 
 
806 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  27.1 
 
 
487 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0959  hypothetical protein  41.18 
 
 
130 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  28.97 
 
 
436 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  28.97 
 
 
436 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  29.7 
 
 
317 aa  44.3  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0962  hypothetical protein  41.18 
 
 
130 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  24.8 
 
 
571 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  27.27 
 
 
183 aa  43.9  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  25.21 
 
 
566 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4082  hypothetical protein  28.18 
 
 
307 aa  43.5  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0556738  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2692  cytochrome C family protein  22.48 
 
 
319 aa  43.5  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0352  cytochrome c family protein  28.9 
 
 
317 aa  43.5  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  24.32 
 
 
321 aa  43.5  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003777  decaheme cytochrome c MtrA  25.94 
 
 
326 aa  43.1  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>