More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0598 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  66.2 
 
 		 884 aa  969    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  100 
 
 		 806 aa  1640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  76.67 
 
 		 712 aa  979    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.85 
 
 		 639 aa  87  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  34.74 
 
 		 623 aa  83.2  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  58.62 
 
 		 1150 aa  82  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  30.53 
 
 		 873 aa  80.5  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  46.81 
 
 		 823 aa  76.6  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  42.2 
 
 		 1081 aa  75.9  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  62.67 
 
 		 1565 aa  75.9  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  63.49 
 
 		 596 aa  75.5  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  39.46 
 
 		 3197 aa  74.7  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  63.93 
 
 		 2066 aa  74.3  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  51.72 
 
 		 816 aa  74.3  0.000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  43.33 
 
 		 967 aa  74.3  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3787  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  42.74 
 
 		 945 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.339008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  47.29 
 
 		 969 aa  72.8  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  44.44 
 
 		 1916 aa  72  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  49.33 
 
 		 971 aa  71.6  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  35.9 
 
 		 677 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  45.26 
 
 		 1057 aa  70.9  0.00000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  27.22 
 
 		 655 aa  70.5  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.44 
 
 		 6885 aa  69.7  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  46.07 
 
 		 778 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  46.07 
 
 		 778 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  46.07 
 
 		 778 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  42.86 
 
 		 775 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  58.93 
 
 		 943 aa  68.6  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  48.75 
 
 		 778 aa  67.8  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3060  collagenase  43.84 
 
 		 960 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0837435  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3299  collagenase  43.84 
 
 		 960 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.675823  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  39.86 
 
 		 3197 aa  67  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  38.06 
 
 		 1107 aa  66.6  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  54.12 
 
 		 521 aa  66.6  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  39.66 
 
 		 820 aa  66.6  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3516  Microbial collagenase  66.67 
 
 		 852 aa  66.6  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  44.05 
 
 		 792 aa  66.6  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  35.78 
 
 		 780 aa  66.6  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2396  Fibronectin type III domain protein  39.77 
 
 		 1050 aa  66.6  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  45.21 
 
 		 971 aa  65.9  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  45.21 
 
 		 971 aa  65.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  45.21 
 
 		 971 aa  65.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  45.21 
 
 		 971 aa  65.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  45.21 
 
 		 1018 aa  65.1  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0166  collagenase  30.95 
 
 		 1104 aa  65.1  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  45.21 
 
 		 971 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  45.21 
 
 		 971 aa  65.1  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  45.21 
 
 		 971 aa  64.7  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  29.95 
 
 		 1027 aa  64.3  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2294  cytochrome c family protein  27.65 
 
 		 179 aa  63.9  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12340  glucose/sorbosone dehydrogenase  46.24 
 
 		 1200 aa  63.9  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217847 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0145  collagenase  42.47 
 
 		 960 aa  63.9  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3915  PKD domain-containing protein  38.04 
 
 		 713 aa  63.9  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  37.89 
 
 		 1771 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.23 
 
 		 942 aa  63.9  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  33.06 
 
 		 777 aa  63.5  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0162  collagenase  30.95 
 
 		 1104 aa  63.9  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7912  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.83 
 
 		 953 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.241269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0429  PKD domain containing protein  43.62 
 
 		 861 aa  62.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  43.84 
 
 		 971 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4149  peptidase M6 immune inhibitor A  50 
 
 		 938 aa  63.2  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  38.35 
 
 		 734 aa  62.4  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0439  subtilisin-like serine protease-like protein  47.76 
 
 		 1151 aa  62.4  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0564398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  43.9 
 
 		 855 aa  62.4  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1255  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  50.88 
 
 		 601 aa  62.4  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.496178 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0523  collagenase,putative  32.61 
 
 		 965 aa  62.4  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.415307  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0466  microbial collagenase  32.61 
 
 		 965 aa  62.4  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0113001  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  40.48 
 
 		 848 aa  62  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0555  collagenase,putative  32.61 
 
 		 965 aa  62.4  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  47.69 
 
 		 948 aa  61.6  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0611  putative microbial collagenase  31.91 
 
 		 965 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4748  putative microbial collagenase  31.91 
 
 		 965 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.369378 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0466  microbial collagenase  34.48 
 
 		 965 aa  61.2  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  23.17 
 
 		 757 aa  61.2  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0684  putative microbial collagenase  32.98 
 
 		 965 aa  60.8  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000922762  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  44.83 
 
 		 774 aa  60.5  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0591  putative microbial collagenase  31.91 
 
 		 965 aa  60.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.129925  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  42.28 
 
 		 848 aa  60.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  45 
 
 		 317 aa  60.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  36.59 
 
 		 517 aa  60.8  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0468  collagenase  32.61 
 
 		 965 aa  60.1  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0616  collagenase,putative  31.91 
 
 		 965 aa  59.3  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  29.63 
 
 		 1602 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  43.75 
 
 		 1601 aa  59.3  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  46.74 
 
 		 552 aa  59.3  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  48.48 
 
 		 938 aa  58.5  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0601  hypothetical protein  50 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000425855  normal  0.13133 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0573  PKD domain containing protein  35.71 
 
 		 1084 aa  57.8  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.179888  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  49.23 
 
 		 944 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  49.23 
 
 		 944 aa  57.8  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.08 
 
 		 940 aa  57.8  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1422  PKD domain containing protein  44.33 
 
 		 400 aa  57.8  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  49.23 
 
 		 944 aa  57.8  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  54.35 
 
 		 918 aa  57  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  32.24 
 
 		 752 aa  57.4  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003663  microbial collagenase secreted  40.85 
 
 		 814 aa  57  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4827  M6 family metalloprotease  60.38 
 
 		 965 aa  57.4  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  29.63 
 
 		 679 aa  56.2  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  47.56 
 
 		 918 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  29.28 
 
 		 861 aa  57  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>