More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0428 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_0465  peptidase M4 thermolysin  68.12 
 
 		 778 aa  1066    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0439  peptidase M4 thermolysin  68.12 
 
 		 778 aa  1068    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0557  peptidase M4 thermolysin  62.64 
 
 		 774 aa  963    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0456  peptidase M4 thermolysin  67.87 
 
 		 778 aa  1065    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  50.77 
 
 		 780 aa  738    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0428  peptidase M4, thermolysin  100 
 
 		 775 aa  1597    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3874  peptidase M4 thermolysin  68.25 
 
 		 778 aa  1070    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3015  peptidase M4, thermolysin  65.42 
 
 		 777 aa  1041    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0371  hemagglutinin/protease  53.34 
 
 		 609 aa  619  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6312  peptidase M4 thermolysin  49.85 
 
 		 759 aa  545  1e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1667  peptidase M4 thermolysin  59.3 
 
 		 791 aa  533  1e-150  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123445  normal  0.274412 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000274  neutral protease precursor  49.4 
 
 		 701 aa  521  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1201  peptidase M4, thermolysin  56.87 
 
 		 485 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.913619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2681  vibriolysin  52.23 
 
 		 500 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161889 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1397  elastase LasB  50.5 
 
 		 498 aa  478  1e-133  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3129  peptidase M4 thermolysin  50.59 
 
 		 499 aa  477  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147708 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16250  elastase LasB  50.59 
 
 		 498 aa  473  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2583  vibriolysin  51.66 
 
 		 500 aa  472  1e-132  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.940274  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2515  vibriolysin  51.63 
 
 		 500 aa  458  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.67369  hitchhiker  0.00118285 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02509  protease  40.42 
 
 		 673 aa  433  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0508  zinc metalloproteinase precursor  37.17 
 
 		 543 aa  318  3e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0532  zinc metalloproteinase precursor  37.08 
 
 		 543 aa  317  4e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0019  hypothetical protein  38.6 
 
 		 558 aa  280  9e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0020  hypothetical protein  38.4 
 
 		 558 aa  277  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  45.88 
 
 		 677 aa  256  8e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  44.28 
 
 		 823 aa  227  8e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3049  hypothetical protein  31.86 
 
 		 553 aa  225  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2906  hypothetical protein  32.06 
 
 		 553 aa  225  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1626  hypothetical protein  31.33 
 
 		 557 aa  219  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1620  hypothetical protein  32.38 
 
 		 557 aa  198  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0670  Thermolysin  32.04 
 
 		 546 aa  177  8e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3645  thermolysin  31.79 
 
 		 532 aa  167  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0278352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0515  thermolysin  29.76 
 
 		 565 aa  160  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000166027  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0567  neutral protease  30.67 
 
 		 566 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0599  neutral protease  30.67 
 
 		 566 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0656  neutral protease Npr599  30.67 
 
 		 566 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.833790000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3166  griselysin  33.91 
 
 		 527 aa  155  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0667  neutral protease  31.16 
 
 		 566 aa  152  2e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.238285  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0509  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  30.88 
 
 		 566 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00722387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0511  bacillolysin (thermolysin-like metalloprotease, peptidase M4)  30.88 
 
 		 566 aa  152  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000111009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0727  neutral protease Npr599  30.53 
 
 		 566 aa  151  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4700  neutral protease Npr599  30.32 
 
 		 566 aa  151  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0638  neutral protease Npr599  30.32 
 
 		 566 aa  150  6e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368383  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0514  thermolysin  30.32 
 
 		 566 aa  147  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0427  peptidase domain-containing protein  46.67 
 
 		 553 aa  142  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  51.64 
 
 		 807 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0556  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  62.26 
 
 		 494 aa  135  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0947915  normal  0.29276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2477  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.11 
 
 		 823 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000447493  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1578  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.53 
 
 		 819 aa  131  6e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000462777  hitchhiker  0.00000000445269 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3041  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  50 
 
 		 807 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.022997  normal  0.0310863 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2799  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.79 
 
 		 819 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000118341  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2779  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.79 
 
 		 819 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000279348  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2874  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.79 
 
 		 819 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000394785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.17 
 
 		 809 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1455  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.17 
 
 		 805 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00029067  hitchhiker  0.000623133 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.17 
 
 		 805 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1409  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.4 
 
 		 803 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000345823  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.59 
 
 		 807 aa  126  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1611  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  52.17 
 
 		 802 aa  127  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0326681 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1408  neutral zinc metallopeptidase M4 family protein  29.09 
 
 		 721 aa  125  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0448524  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2692  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  57 
 
 		 818 aa  126  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2185  cold-active serine alkaline protease  54.55 
 
 		 803 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000390899  decreased coverage  0.00433013 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2213  peptidase M4 thermolysin  34.62 
 
 		 556 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000134163  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4623  peptidase domain-containing protein  49.57 
 
 		 658 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.272632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0375  neutral protease  29.63 
 
 		 556 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1523  extracellular metalloprotease precursor protein  43.95 
 
 		 351 aa  117  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.103754  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2252  extracellular elastase precursor  27.06 
 
 		 507 aa  116  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0751  cold-active alkaline serine protease  52.83 
 
 		 789 aa  113  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2373  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  58.59 
 
 		 628 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.200632  normal  0.503534 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1599  peptidase M4 thermolysin  31.87 
 
 		 556 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000990098  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3289  endonuclease I  48.6 
 
 		 542 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000363328  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.46 
 
 		 835 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1208  metalloprotease  26.77 
 
 		 1031 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  37.37 
 
 		 1154 aa  112  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0042  neutral protease  31.58 
 
 		 556 aa  112  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000223504  normal  0.0464534 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3194  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.37 
 
 		 629 aa  112  3e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2871  cold-active alkaline serine protease  45.26 
 
 		 789 aa  112  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3338  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.37 
 
 		 629 aa  112  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001489  alkaline serine exoprotease A precursor  48.67 
 
 		 534 aa  111  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.4 
 
 		 629 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02449  hypothetical protein  45.38 
 
 		 489 aa  109  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0061  neutral protease B  29.6 
 
 		 556 aa  109  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0235216  hitchhiker  0.000405406 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1173  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  53.4 
 
 		 629 aa  109  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2045  peptidase M4 thermolysin  40.85 
 
 		 353 aa  108  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.912259 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2661  zinc metalloproteinase aureolysin  27.59 
 
 		 509 aa  108  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.502618  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2717  zinc metalloproteinase aureolysin  27.59 
 
 		 509 aa  108  5e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5152  neutral protease B  28.92 
 
 		 549 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000564161 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4752  neutral protease B  28.92 
 
 		 554 aa  107  6e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000177713  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1623  peptidase M4, thermolysin  35.07 
 
 		 375 aa  107  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3006  peptidase M4 thermolysin  35.57 
 
 		 347 aa  108  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1016  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.62 
 
 		 630 aa  107  8e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04205  neutral protease A  40.91 
 
 		 221 aa  107  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04872  cold-active alkaline serine protease  50.5 
 
 		 794 aa  107  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4771  neutral protease B  28.43 
 
 		 554 aa  105  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5197  neutral protease B  28.64 
 
 		 591 aa  105  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5188  neutral protease B  28.39 
 
 		 591 aa  105  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.32835  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09051  thermolysin  26.81 
 
 		 984 aa  105  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5252  peptidase M4 thermolysin  31.5 
 
 		 356 aa  105  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0068319  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1266  peptidase M4 thermolysin  34.54 
 
 		 347 aa  105  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248028  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.73 
 
 		 836 aa  104  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>