89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0338 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  100 
 
 		 969 aa  1990    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3119  hypothetical protein  35.34 
 
 		 645 aa  307  7e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2927  hypothetical protein  40.75 
 
 		 649 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.956514  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3012  hypothetical protein  39.81 
 
 		 649 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0326564  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2160  cytochrome c5530 family protein  28.23 
 
 		 1062 aa  275  3e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.870345  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0421  cytochrome c5530 family protein  26.53 
 
 		 1107 aa  271  5.9999999999999995e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0800072  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2259  cytochrome c5530 family protein  27.93 
 
 		 1069 aa  267  5.999999999999999e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2881  hypothetical protein  33.33 
 
 		 578 aa  235  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0423  cytochrome c5530  34.18 
 
 		 1158 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183193  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2156  hypothetical protein  30.7 
 
 		 543 aa  185  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849073  normal  0.0510024 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  26.59 
 
 		 881 aa  110  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0561  cytochrome c family protein  26.64 
 
 		 559 aa  94.4  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  24.12 
 
 		 897 aa  91.3  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  50 
 
 		 712 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0274  cytochrome c, class I  23.68 
 
 		 589 aa  77.8  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  38.51 
 
 		 1771 aa  76.3  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  50 
 
 		 884 aa  72.4  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  24.15 
 
 		 643 aa  70.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  39.43 
 
 		 1418 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  42.86 
 
 		 1150 aa  65.5  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  21.86 
 
 		 581 aa  65.1  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00841  PKD domain protein  37.6 
 
 		 1098 aa  62  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  44.35 
 
 		 855 aa  61.6  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  45.92 
 
 		 848 aa  59.7  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  35.25 
 
 		 1004 aa  60.1  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  46.74 
 
 		 816 aa  58.5  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.08 
 
 		 1212 aa  58.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  40.16 
 
 		 833 aa  58.5  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  41.32 
 
 		 1022 aa  58.2  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2572  hypothetical protein  39.18 
 
 		 1608 aa  57  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  41.51 
 
 		 868 aa  57  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1678  hypothetical protein  45.45 
 
 		 940 aa  57  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507171  hitchhiker  0.000632186 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  45.45 
 
 		 1565 aa  56.6  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3229  collagenase  36.43 
 
 		 971 aa  55.5  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  38.05 
 
 		 1011 aa  55.1  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1422  PKD domain containing protein  43 
 
 		 400 aa  54.3  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  40.57 
 
 		 868 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  41.28 
 
 		 2066 aa  53.9  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05515  zinc metalloprotease  45.19 
 
 		 780 aa  53.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  47.96 
 
 		 806 aa  53.5  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  40.57 
 
 		 868 aa  53.1  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  47.44 
 
 		 623 aa  52.4  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0486  collagenase  32.8 
 
 		 967 aa  52.4  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.008095  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  40.23 
 
 		 1916 aa  52.4  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0223  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  51.61 
 
 		 596 aa  52  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.221724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  37.4 
 
 		 848 aa  51.6  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  32.99 
 
 		 746 aa  51.6  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  40.23 
 
 		 792 aa  51.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3539  collagenase, putative  36.7 
 
 		 971 aa  50.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  51.43 
 
 		 639 aa  50.1  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1097  Kelch repeat-containing protein  38.82 
 
 		 1557 aa  50.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612946  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  37.69 
 
 		 869 aa  50.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1703  hypothetical protein  24.21 
 
 		 487 aa  50.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000330432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  34.59 
 
 		 873 aa  50.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  36.23 
 
 		 634 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3238  collagenase  35.78 
 
 		 1018 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  33.57 
 
 		 563 aa  47.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  34.43 
 
 		 706 aa  47.4  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3414  aminopeptidase-like protein  33.94 
 
 		 677 aa  47.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0744  serine protease  30.15 
 
 		 1725 aa  47.4  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  49.18 
 
 		 461 aa  47.4  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.11 
 
 		 1217 aa  47.4  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3323  collagenase  34.86 
 
 		 971 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  33.6 
 
 		 1750 aa  47.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  32.47 
 
 		 972 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0484  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.81 
 
 		 2668 aa  47.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3584  collagenase  34.86 
 
 		 971 aa  47.4  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.629747  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3636  putative microbial collagenase  36.84 
 
 		 971 aa  47.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3286  collagenase  34.86 
 
 		 971 aa  47  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238892  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  40.21 
 
 		 868 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3538  putative microbial collagenase  34.86 
 
 		 971 aa  47  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.60161e-19 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  32.46 
 
 		 1081 aa  46.6  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  40.21 
 
 		 868 aa  47  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  40.21 
 
 		 867 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  40.21 
 
 		 868 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3542  putative microbial collagenase  34.86 
 
 		 971 aa  47  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1373  hypothetical protein  30.57 
 
 		 541 aa  46.2  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  37.72 
 
 		 635 aa  46.6  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  40.95 
 
 		 665 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  38.2 
 
 		 1057 aa  45.8  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  35.25 
 
 		 634 aa  45.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2748  hypothetical protein  36.03 
 
 		 1601 aa  45.4  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  35.29 
 
 		 635 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  38.68 
 
 		 863 aa  45.4  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  35.78 
 
 		 611 aa  45.4  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  37.93 
 
 		 773 aa  45.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  38 
 
 		 1376 aa  45.1  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  46.97 
 
 		 521 aa  44.7  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1680  putative microbial collagenase  33.94 
 
 		 971 aa  44.7  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0340823  hitchhiker  1.3122e-17 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>