17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0423 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0423  cytochrome c5530  100 
 
 		 1158 aa  2393    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183193  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2259  cytochrome c5530 family protein  38.88 
 
 		 1069 aa  323  9.000000000000001e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2160  cytochrome c5530 family protein  37.04 
 
 		 1062 aa  320  1e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.870345  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0421  cytochrome c5530 family protein  41.96 
 
 		 1107 aa  307  8.000000000000001e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0800072  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  34.18 
 
 		 969 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2927  hypothetical protein  32.38 
 
 		 649 aa  135  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.956514  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3012  hypothetical protein  31.52 
 
 		 649 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0326564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3119  hypothetical protein  31.23 
 
 		 645 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2156  hypothetical protein  25.21 
 
 		 543 aa  90.1  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849073  normal  0.0510024 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2881  hypothetical protein  26.15 
 
 		 578 aa  87.8  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  25.49 
 
 		 897 aa  55.8  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  26.58 
 
 		 881 aa  55.5  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0561  cytochrome c family protein  25.42 
 
 		 559 aa  54.3  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0274  cytochrome c, class I  40 
 
 		 589 aa  51.6  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  26.79 
 
 		 581 aa  51.6  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  25.96 
 
 		 643 aa  50.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  23.45 
 
 		 841 aa  45.1  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>