49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2631 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  43.3 
 
 		 841 aa  729    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  100 
 
 		 881 aa  1823    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  54.54 
 
 		 897 aa  1025    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0561  cytochrome c family protein  50.38 
 
 		 559 aa  527  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0274  cytochrome c, class I  49.63 
 
 		 589 aa  523  1e-147  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1762  Cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  50 
 
 		 585 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0901086  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2531  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  49.53 
 
 		 435 aa  423  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0759  cytochrome c family protein  46.46 
 
 		 430 aa  385  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.15684  normal  0.177346 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  45.1 
 
 		 581 aa  365  2e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  43.45 
 
 		 643 aa  348  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2570  cytochrome c family protein  42.37 
 
 		 430 aa  304  4.0000000000000003e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5189  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  31.04 
 
 		 490 aa  211  6e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6091  putative cytochrome  32.01 
 
 		 499 aa  209  2e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0717  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  30.07 
 
 		 455 aa  196  1e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000111138  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0683  cytochrome c class I  29.49 
 
 		 473 aa  188  3e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232774  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2026  hypothetical protein  28.41 
 
 		 468 aa  177  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3012  hypothetical protein  32.57 
 
 		 649 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0326564  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1846  cytochrome c class I  29.15 
 
 		 493 aa  172  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0017395  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0596  hypothetical protein  28.32 
 
 		 468 aa  172  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0539689  unclonable  0.00000913537 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2881  hypothetical protein  30.75 
 
 		 578 aa  171  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3119  hypothetical protein  32.42 
 
 		 645 aa  170  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0368  conserved hypothetical protein, putative cytochrome  30.91 
 
 		 459 aa  167  9e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.897935  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2669  hypothetical protein  28.23 
 
 		 470 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.18074  unclonable  0.0000000282575 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2156  hypothetical protein  29.84 
 
 		 543 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849073  normal  0.0510024 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3898  hypothetical protein  27.78 
 
 		 467 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000694886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2927  hypothetical protein  32.78 
 
 		 649 aa  164  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.956514  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0543  cytochrome c class I  27.58 
 
 		 445 aa  159  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1187  cytochrome c family protein  31.27 
 
 		 455 aa  154  5e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872906  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  26.59 
 
 		 969 aa  111  7.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1703  hypothetical protein  26.09 
 
 		 487 aa  90.5  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000330432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2955  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  26.62 
 
 		 443 aa  60.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2709  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  25.98 
 
 		 441 aa  56.2  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0423  cytochrome c5530  26.58 
 
 		 1158 aa  55.5  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183193  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2567  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like protein  25.49 
 
 		 448 aa  55.1  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6580  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  26.09 
 
 		 521 aa  48.9  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  23.71 
 
 		 615 aa  48.9  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0421  cytochrome c5530 family protein  35.48 
 
 		 1107 aa  47.8  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0800072  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1168  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  27.55 
 
 		 453 aa  47.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.89763  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1146  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  27.55 
 
 		 453 aa  47.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.628906  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  28.3 
 
 		 577 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2160  cytochrome c5530 family protein  30.41 
 
 		 1062 aa  47.4  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.870345  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  24.04 
 
 		 757 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0672  cytochrome d ubiquinol oxidase, subunit I  26.55 
 
 		 451 aa  46.6  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1000  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  28.91 
 
 		 448 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.774186  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0997  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  28.91 
 
 		 448 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.702896  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0256  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  25.55 
 
 		 555 aa  46.2  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0939  cytochrome bd ubiquinol oxidase, subunit I  28.91 
 
 		 449 aa  46.2  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0224772  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0327  hypothetical protein  28.43 
 
 		 187 aa  45.4  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.126793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0981  cytochrome bd ubiquinol oxidase subunit I  29.93 
 
 		 444 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00380609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>