23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2532 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  100 
 
 		 643 aa  1311    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  50.54 
 
 		 581 aa  580  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0561  cytochrome c family protein  45.55 
 
 		 559 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  42.61 
 
 		 897 aa  366  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  43.2 
 
 		 881 aa  353  7e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0274  cytochrome c, class I  41.08 
 
 		 589 aa  337  5e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  42.12 
 
 		 841 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2156  hypothetical protein  26.65 
 
 		 543 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849073  normal  0.0510024 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2927  hypothetical protein  30.83 
 
 		 649 aa  120  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.956514  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3012  hypothetical protein  30.52 
 
 		 649 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0326564  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3119  hypothetical protein  30.13 
 
 		 645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2881  hypothetical protein  25.77 
 
 		 578 aa  102  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  23.93 
 
 		 969 aa  72  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1703  hypothetical protein  26.58 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000330432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2420  cytochrome c class III  32.71 
 
 		 136 aa  60.8  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000311194 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3004  cytochrome c class III  36.52 
 
 		 142 aa  60.8  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2160  cytochrome c5530 family protein  24.88 
 
 		 1062 aa  52.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.870345  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0423  cytochrome c5530  25.96 
 
 		 1158 aa  50.1  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183193  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0413  cytochrome c class III  36.26 
 
 		 133 aa  47.8  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.168464 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1266  cytochrome c class III  36.17 
 
 		 224 aa  46.6  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113202  normal  0.0397908 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  29.9 
 
 		 135 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1800  cytochrome c class III  31.78 
 
 		 151 aa  44.3  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.679004 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  27.78 
 
 		 577 aa  44.3  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>