18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2881 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2881  hypothetical protein  100 
 
 		 578 aa  1194    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2156  hypothetical protein  51.43 
 
 		 543 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.849073  normal  0.0510024 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3119  hypothetical protein  41.51 
 
 		 645 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3012  hypothetical protein  41.16 
 
 		 649 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0326564  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2927  hypothetical protein  41.33 
 
 		 649 aa  350  4e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.956514  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  33.27 
 
 		 969 aa  237  5.0000000000000005e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0561  cytochrome c family protein  30.83 
 
 		 559 aa  180  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.102352  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2631  cytochrome c class I  30.53 
 
 		 881 aa  178  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.331063  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0454  cytochrome c family protein  31.39 
 
 		 897 aa  172  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.523502  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0274  cytochrome c, class I  30.15 
 
 		 589 aa  150  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0339591 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0760  cytochrome c, class III  24.83 
 
 		 581 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  0.192242 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2160  cytochrome c5530 family protein  26.51 
 
 		 1062 aa  107  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.870345  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2532  cytochrome c class III  25.77 
 
 		 643 aa  104  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1703  hypothetical protein  26.86 
 
 		 487 aa  96.3  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000330432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0423  cytochrome c5530  26.51 
 
 		 1158 aa  89  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.183193  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0291  cytochrome bd-type quinol oxidase subunit 1-like  24.16 
 
 		 841 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0421  cytochrome c5530 family protein  25.71 
 
 		 1107 aa  80.5  0.00000000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0800072  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2259  cytochrome c5530 family protein  24.24 
 
 		 1069 aa  67  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>