67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00841 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00841  PKD domain protein  100 
 
 		 1098 aa  2222    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  30.12 
 
 		 1011 aa  72  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  42.99 
 
 		 833 aa  70.9  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2789  bacillolysin  36.47 
 
 		 893 aa  65.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000716183  hitchhiker  0.000000152737 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2581  neutral protease  36.36 
 
 		 884 aa  64.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011855 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.62 
 
 		 1212 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2534  neutral protease  37.01 
 
 		 887 aa  63.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.596256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2393  thermolysin metallopeptidase  36.36 
 
 		 530 aa  63.5  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0338  cytochrome c5530 family protein  34.76 
 
 		 969 aa  62.8  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.808886  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  41.98 
 
 		 746 aa  61.2  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  34.29 
 
 		 848 aa  59.7  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  35 
 
 		 855 aa  59.7  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  29.2 
 
 		 1107 aa  60.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  36.3 
 
 		 884 aa  59.3  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  35.51 
 
 		 1771 aa  58.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  30.13 
 
 		 2272 aa  58.2  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2310  bacillolysin  40.74 
 
 		 886 aa  58.2  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105645  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  36.14 
 
 		 848 aa  57.4  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  35.5 
 
 		 978 aa  56.6  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2571  neutral protease A, bacillolysin  32.97 
 
 		 891 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000442231  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  38.71 
 
 		 503 aa  56.2  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  40.48 
 
 		 1750 aa  56.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2348  bacillolysin (neutral protease)  33.55 
 
 		 890 aa  55.8  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00113983  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  35.09 
 
 		 902 aa  55.8  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2624  bacillolysin  35.06 
 
 		 891 aa  55.1  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000636329  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3966  phospholipase/carboxylesterase  42.68 
 
 		 795 aa  54.7  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2383  putative surface protein  36.17 
 
 		 929 aa  53.9  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  41.84 
 
 		 712 aa  53.1  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  27.65 
 
 		 950 aa  53.9  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  36.54 
 
 		 635 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.19 
 
 		 1217 aa  52.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  36.54 
 
 		 635 aa  52.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  39.83 
 
 		 816 aa  52.4  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  34.63 
 
 		 1682 aa  51.6  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  37.76 
 
 		 1022 aa  50.4  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  32.91 
 
 		 940 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2204  PKD  35.92 
 
 		 634 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  33.58 
 
 		 901 aa  50.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  37.04 
 
 		 727 aa  50.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  38.52 
 
 		 1565 aa  50.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  38.55 
 
 		 1004 aa  49.3  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1975  hypothetical protein  34.23 
 
 		 967 aa  49.3  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000301767  hitchhiker  0.0000479173 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  36.59 
 
 		 816 aa  49.3  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  37.31 
 
 		 994 aa  49.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  31.58 
 
 		 699 aa  48.9  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  33.61 
 
 		 656 aa  48.9  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  32.69 
 
 		 972 aa  48.5  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  36.59 
 
 		 1011 aa  48.9  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  32.8 
 
 		 1376 aa  48.1  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  33.64 
 
 		 994 aa  48.1  0.0009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0686  hypothetical protein  29.46 
 
 		 732 aa  47.4  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.621901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  45.07 
 
 		 3197 aa  47  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0512  PKD domain-containing protein  30.57 
 
 		 706 aa  47  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.0022816  normal  0.634462 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  36.14 
 
 		 1258 aa  47.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34810  esterase, poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  35.14 
 
 		 501 aa  46.2  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0712  hypothetical protein  32.21 
 
 		 634 aa  46.2  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.748161  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30 
 
 		 911 aa  46.2  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  30.5 
 
 		 735 aa  46.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  43.66 
 
 		 3197 aa  45.8  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2125  protein of unknown function DUF1593  31.82 
 
 		 477 aa  46.2  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  28.38 
 
 		 1204 aa  45.4  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1989  Hyalin  33.33 
 
 		 610 aa  45.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.160396  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  32 
 
 		 861 aa  45.4  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  29.21 
 
 		 565 aa  45.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  31.16 
 
 		 2000 aa  45.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  35.34 
 
 		 1057 aa  45.1  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  34.64 
 
 		 792 aa  44.7  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>