17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0686 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0686  hypothetical protein  100 
 
 		 732 aa  1495    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.621901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  25.13 
 
 		 901 aa  124  5e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0423  hypothetical protein  23.93 
 
 		 809 aa  107  8e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  27.4 
 
 		 902 aa  93.2  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3113  hypothetical protein  27.94 
 
 		 757 aa  86.7  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0847993 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  36.29 
 
 		 816 aa  66.6  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.23 
 
 		 1212 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  30.94 
 
 		 848 aa  52.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  31.91 
 
 		 855 aa  53.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  36.46 
 
 		 1393 aa  50.8  0.00009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  33.6 
 
 		 450 aa  49.3  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00117  hypothetical protein  29.9 
 
 		 598 aa  48.5  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3892  hypothetical protein  28.66 
 
 		 644 aa  48.5  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.810421  normal  0.0279299 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  29.45 
 
 		 1771 aa  48.5  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  33.03 
 
 		 1107 aa  48.1  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00841  PKD domain protein  29.46 
 
 		 1098 aa  47.8  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1188  hypothetical protein  30.4 
 
 		 645 aa  46.6  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000309413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>