70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1180 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  87.47 
 
 		 901 aa  1605    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  100 
 
 		 902 aa  1820    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0423  hypothetical protein  34.46 
 
 		 809 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3113  hypothetical protein  25.11 
 
 		 757 aa  140  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0847993 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0686  hypothetical protein  23.96 
 
 		 732 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.621901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  41.53 
 
 		 1393 aa  105  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  39.46 
 
 		 1393 aa  100  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  38.3 
 
 		 656 aa  95.9  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  38.22 
 
 		 1107 aa  89  4e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.29 
 
 		 1217 aa  84  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  30.57 
 
 		 3278 aa  82  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  37.18 
 
 		 1750 aa  79.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  36.93 
 
 		 972 aa  79  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  28.98 
 
 		 816 aa  77  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  38.99 
 
 		 869 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  37.27 
 
 		 868 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  35.68 
 
 		 868 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  37.89 
 
 		 867 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  38.04 
 
 		 868 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  36.65 
 
 		 868 aa  75.1  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.37 
 
 		 1212 aa  74.7  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  37.42 
 
 		 868 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  37.42 
 
 		 868 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  30.98 
 
 		 855 aa  70.9  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  45.36 
 
 		 1311 aa  67.4  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  30.72 
 
 		 611 aa  64.7  0.000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  37.42 
 
 		 1771 aa  63.9  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  32.53 
 
 		 863 aa  63.9  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  35 
 
 		 833 aa  63.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  36.36 
 
 		 820 aa  62.4  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  29.35 
 
 		 848 aa  60.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  30.69 
 
 		 848 aa  60.8  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  29.86 
 
 		 994 aa  60.1  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0832  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.48 
 
 		 1292 aa  59.7  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  37.96 
 
 		 826 aa  58.2  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0513  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40 
 
 		 1212 aa  57.4  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  26.27 
 
 		 985 aa  56.6  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  42.34 
 
 		 913 aa  55.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  38 
 
 		 1011 aa  54.3  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0781  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.1 
 
 		 1283 aa  53.5  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.223596  hitchhiker  0.00753256 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0555  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.06 
 
 		 1399 aa  52.8  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0581373 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2588  hypothetical protein  34.46 
 
 		 1022 aa  51.6  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0819  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.92 
 
 		 1286 aa  51.2  0.00009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000454384 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3585  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.54 
 
 		 1212 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.591718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3517  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.54 
 
 		 1212 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.183545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3708  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.54 
 
 		 1212 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.342982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  28.88 
 
 		 635 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  31.48 
 
 		 873 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  29.94 
 
 		 571 aa  49.3  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  30.85 
 
 		 623 aa  49.7  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  29.44 
 
 		 816 aa  49.3  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  31.44 
 
 		 1057 aa  49.3  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3303  chitinase domain-containing protein  30 
 
 		 814 aa  48.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3800  serine protease  39.62 
 
 		 1215 aa  47.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  29.79 
 
 		 635 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3050  protease-associated PA  36.61 
 
 		 1220 aa  47  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000558142  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.11 
 
 		 850 aa  46.6  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.5 
 
 		 911 aa  47  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00841  PKD domain protein  35.48 
 
 		 1098 aa  46.6  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  38.32 
 
 		 3197 aa  46.2  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  34.04 
 
 		 1150 aa  45.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2857  hypothetical protein  38.55 
 
 		 1208 aa  45.8  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0899  hypothetical protein  34.33 
 
 		 987 aa  45.8  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0750964  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.98 
 
 		 994 aa  45.8  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  39.78 
 
 		 746 aa  45.1  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  37.86 
 
 		 3197 aa  45.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2764  PKD domain containing protein  34.04 
 
 		 1084 aa  44.7  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  33.54 
 
 		 734 aa  45.1  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  33.7 
 
 		 1258 aa  44.7  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  28.95 
 
 		 1565 aa  44.7  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>