31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0423 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0423  hypothetical protein  100 
 
 		 809 aa  1641    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  34.5 
 
 		 901 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  34.71 
 
 		 902 aa  380  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3113  hypothetical protein  26.58 
 
 		 757 aa  125  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0847993 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0686  hypothetical protein  24.21 
 
 		 732 aa  111  6e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.621901  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  39.37 
 
 		 816 aa  74.3  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  51.81 
 
 		 848 aa  70.1  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1188  hypothetical protein  35.71 
 
 		 645 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000309413  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  55.93 
 
 		 848 aa  66.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  40.7 
 
 		 1107 aa  63.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  32.56 
 
 		 611 aa  62  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  37.65 
 
 		 855 aa  55.8  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00117  hypothetical protein  26.02 
 
 		 598 aa  56.2  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  48.33 
 
 		 1212 aa  54.7  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1752  hypothetical protein  32.88 
 
 		 646 aa  53.5  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.76 
 
 		 911 aa  53.5  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  39.44 
 
 		 3278 aa  52  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.44 
 
 		 1217 aa  51.6  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  34.94 
 
 		 950 aa  51.2  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  34.48 
 
 		 1393 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  43.42 
 
 		 1311 aa  50.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  34.38 
 
 		 1011 aa  50.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  38.36 
 
 		 1393 aa  49.3  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3893  hypothetical protein  22.67 
 
 		 640 aa  49.3  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.429721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  43.64 
 
 		 1750 aa  48.9  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  33.67 
 
 		 820 aa  48.5  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3292  hypothetical protein  48.08 
 
 		 571 aa  48.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764747  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  44.26 
 
 		 972 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.06 
 
 		 913 aa  45.8  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  34.86 
 
 		 460 aa  46.2  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  37.21 
 
 		 833 aa  44.3  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>