18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1752 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1752  hypothetical protein  100 
 
 		 646 aa  1344    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1787  hypothetical protein  48.63 
 
 		 651 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.036788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2498  hypothetical protein  48.63 
 
 		 651 aa  588  1e-166  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.305411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1824  hypothetical protein  48.15 
 
 		 651 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000670004  normal  0.339421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1646  hypothetical protein  48.75 
 
 		 642 aa  578  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.402123 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1780  hypothetical protein  47.01 
 
 		 651 aa  580  1e-164  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2876  hypothetical protein  47.76 
 
 		 650 aa  578  1e-164  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1644  hypothetical protein  46.41 
 
 		 662 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2350  hypothetical protein  47.89 
 
 		 651 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000563575  unclonable  0.0000000000441707 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2422  hypothetical protein  47.74 
 
 		 644 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000907075  decreased coverage  0.000210671 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2165  hypothetical protein  44.56 
 
 		 656 aa  566  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1692  hypothetical protein  47.5 
 
 		 649 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323306  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2440  hypothetical protein  46.37 
 
 		 642 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616758 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1968  hypothetical protein  45.2 
 
 		 645 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00352196  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3193  putative lipoprotein  37.54 
 
 		 647 aa  380  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.52328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3540  hypothetical protein  40.05 
 
 		 433 aa  258  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0423  hypothetical protein  32.88 
 
 		 809 aa  53.5  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1188  hypothetical protein  32.09 
 
 		 645 aa  50.1  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000309413  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>