18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_2876 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009052  Sbal_1787  hypothetical protein  74.69 
 
 		 651 aa  1021    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.036788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2498  hypothetical protein  74.85 
 
 		 651 aa  1023    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.305411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2165  hypothetical protein  54.15 
 
 		 656 aa  694    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1824  hypothetical protein  74.39 
 
 		 651 aa  1016    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000670004  normal  0.339421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1968  hypothetical protein  55.76 
 
 		 645 aa  693    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00352196  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2440  hypothetical protein  52.97 
 
 		 642 aa  683    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1780  hypothetical protein  74.69 
 
 		 651 aa  1021    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000137032  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1692  hypothetical protein  72.38 
 
 		 649 aa  972    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323306  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1646  hypothetical protein  85.54 
 
 		 642 aa  1128    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.402123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2422  hypothetical protein  86.05 
 
 		 644 aa  1123    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000907075  decreased coverage  0.000210671 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2350  hypothetical protein  85.28 
 
 		 651 aa  1127    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000563575  unclonable  0.0000000000441707 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1644  hypothetical protein  56.4 
 
 		 662 aa  715    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2876  hypothetical protein  100 
 
 		 650 aa  1335    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1752  hypothetical protein  47.76 
 
 		 646 aa  595  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3193  putative lipoprotein  43.64 
 
 		 647 aa  439  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.52328  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3540  hypothetical protein  37.89 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1188  hypothetical protein  28.93 
 
 		 645 aa  50.8  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000309413  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0899  hypothetical protein  34.12 
 
 		 987 aa  44.3  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0750964  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>