107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1188 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1188  hypothetical protein  100 
 
 		 645 aa  1321    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000309413  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2388  hypothetical protein  45.52 
 
 		 604 aa  364  3e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05702  hypothetical protein  39.57 
 
 		 520 aa  342  2e-92  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000086  hypothetical protein  45.41 
 
 		 522 aa  336  7e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4494  hypothetical protein  38.21 
 
 		 635 aa  301  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4704  hypothetical protein  37.5 
 
 		 647 aa  287  5e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3513  hypothetical protein  35.04 
 
 		 587 aa  249  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0370611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06462  hypothetical protein  31.79 
 
 		 494 aa  217  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6010  hypothetical protein  28.07 
 
 		 533 aa  85.1  0.000000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5247  hypothetical protein  27.62 
 
 		 500 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6143  hypothetical protein  28.03 
 
 		 500 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1936  hypothetical protein  28.03 
 
 		 500 aa  84  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5179  hypothetical protein  30.5 
 
 		 507 aa  83.2  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0826405  normal  0.151429 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1960  hypothetical protein  28.03 
 
 		 500 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0216977  normal  0.925568 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1924  hypothetical protein  27.2 
 
 		 515 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.947079  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1851  hypothetical protein  27.2 
 
 		 505 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942096  hitchhiker  0.000233455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1793  hypothetical protein  29.77 
 
 		 511 aa  77.8  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1335  hypothetical protein  26.78 
 
 		 503 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  decreased coverage  0.0000870574 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0047  Protein of unknown function DUF1800  25.6 
 
 		 545 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0385288  normal  0.588647 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1650  signal peptide protein  23.43 
 
 		 538 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2096  hypothetical protein  24.03 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.728518  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1881  Protein of unknown function DUF1800  26.74 
 
 		 548 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.126804 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5240  hypothetical protein  28.1 
 
 		 524 aa  74.7  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.091934  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1567  Protein of unknown function DUF1800  24.45 
 
 		 545 aa  73.9  0.000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00854272  normal  0.266743 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4117  Protein of unknown function DUF1800  25.36 
 
 		 526 aa  73.9  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.970573  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3058  hypothetical protein  30.42 
 
 		 555 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.417569  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2504  hypothetical protein  23.32 
 
 		 467 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314107  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2349  hypothetical protein  23.32 
 
 		 471 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.475225  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2391  hypothetical protein  23.32 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2282  hypothetical protein  26.69 
 
 		 549 aa  72.4  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349659  hitchhiker  0.0000222202 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2305  hypothetical protein  25.77 
 
 		 513 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2159  hypothetical protein  24.91 
 
 		 565 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1188  Protein of unknown function DUF1800  22.73 
 
 		 453 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1896  Protein of unknown function DUF1800  23.51 
 
 		 541 aa  71.2  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.018733  normal  0.180633 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1682  hypothetical protein  25.51 
 
 		 525 aa  70.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4696  Protein of unknown function DUF1800  26.23 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3566  hypothetical protein  24.37 
 
 		 668 aa  70.9  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3316  Protein of unknown function DUF1800  27.05 
 
 		 533 aa  70.9  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5539  hypothetical protein  24.71 
 
 		 508 aa  70.1  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101911  normal  0.180912 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2115  Protein of unknown function DUF1800  26.46 
 
 		 628 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.034935  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1484  hypothetical protein  22.97 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00691345  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1977  hypothetical protein  22.97 
 
 		 487 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0132542  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3328  hypothetical protein  22.97 
 
 		 487 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0104946  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1250  hypothetical protein  22.97 
 
 		 471 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2447  hypothetical protein  26.3 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0601208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7109  Protein of unknown function DUF1800  24.19 
 
 		 548 aa  68.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  37.98 
 
 		 816 aa  68.2  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0423  hypothetical protein  35.71 
 
 		 809 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3875  Protein of unknown function DUF1800  23.8 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00620003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5993  Protein of unknown function DUF1800  25.9 
 
 		 478 aa  67  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2472  Protein of unknown function DUF1800  26.32 
 
 		 404 aa  67  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.230018  decreased coverage  0.00526107 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4838  hypothetical protein  27.13 
 
 		 526 aa  66.6  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0664961 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4216  hypothetical protein  26.34 
 
 		 454 aa  67  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114033 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1102  Protein of unknown function DUF1800  24.15 
 
 		 458 aa  66.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3913  hypothetical protein  24.32 
 
 		 464 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4005  hypothetical protein  27.08 
 
 		 423 aa  65.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0200  Protein of unknown function DUF1800  25.96 
 
 		 470 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4377  hypothetical protein  24.32 
 
 		 464 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.877335 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3483  hypothetical protein  25.09 
 
 		 553 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.201338 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4237  Protein of unknown function DUF1800  24.3 
 
 		 541 aa  64.7  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000229991  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1206  hypothetical protein  25.76 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4978  hypothetical protein  26 
 
 		 495 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1450  hypothetical protein  23.33 
 
 		 605 aa  63.5  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3892  hypothetical protein  24.62 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.321075  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4476  hypothetical protein  24.62 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5827  hypothetical protein  24.88 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0551866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2867  hypothetical protein  23.83 
 
 		 665 aa  62  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1626  hypothetical protein  26.03 
 
 		 507 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0161369  normal  0.163246 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3442  Protein of unknown function DUF1800  23.84 
 
 		 496 aa  60.8  0.00000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.24616  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4087  hypothetical protein  23.37 
 
 		 500 aa  60.5  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1384  hypothetical protein  24.88 
 
 		 535 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.478917  normal  0.181741 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2770  hypothetical protein  26.92 
 
 		 454 aa  60.5  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.818772  normal  0.0752595 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02838  hypothetical protein  25.28 
 
 		 529 aa  59.3  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0376  Protein of unknown function DUF1800  29.12 
 
 		 664 aa  58.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4879  hypothetical protein  25.97 
 
 		 532 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0484616  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2721  hypothetical protein  22.22 
 
 		 572 aa  56.2  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5024  Protein of unknown function DUF1800  23.32 
 
 		 519 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0654907  normal  0.102883 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2550  Protein of unknown function DUF1800  22.7 
 
 		 654 aa  54.7  0.000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.392949  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2279  hypothetical protein  25.29 
 
 		 311 aa  53.9  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.000123054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0921  hypothetical protein  33.86 
 
 		 989 aa  52.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2165  hypothetical protein  31.74 
 
 		 656 aa  53.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2237  hypothetical protein  23.51 
 
 		 653 aa  53.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0773  Protein of unknown function DUF1800  27.81 
 
 		 643 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1644  hypothetical protein  29.19 
 
 		 662 aa  52  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1788  Protein of unknown function DUF1800  24.71 
 
 		 435 aa  51.6  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  30.72 
 
 		 611 aa  51.2  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  36.19 
 
 		 1107 aa  51.2  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0166  Protein of unknown function DUF1800  30.77 
 
 		 555 aa  50.8  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1752  hypothetical protein  32.09 
 
 		 646 aa  50.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1975  hypothetical protein  23.63 
 
 		 460 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527872  normal  0.596923 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2851  hypothetical protein  24.42 
 
 		 471 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  35.87 
 
 		 848 aa  49.7  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1054  hypothetical protein  27.61 
 
 		 991 aa  48.9  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0519  hypothetical protein  19.83 
 
 		 465 aa  48.5  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.167553  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2339  hypothetical protein  25.32 
 
 		 522 aa  47.8  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.428867  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  29.85 
 
 		 460 aa  47  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  39.66 
 
 		 1393 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1610  hypothetical protein  25.35 
 
 		 455 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00247546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2962  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.61 
 
 		 351 aa  47.4  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2391  hypothetical protein  23.12 
 
 		 471 aa  45.8  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0167986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>