81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2139 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2139  hypothetical protein  100 
 
 		 1011 aa  2056    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000321254  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2014  peptidase C25 gingipain  28.32 
 
 		 994 aa  177  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0011841  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2043  parallel beta-helix repeat-containing protein  68.75 
 
 		 2031 aa  147  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  44.64 
 
 		 848 aa  90.9  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  42.61 
 
 		 848 aa  84.7  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1733  hypothetical protein  48.91 
 
 		 746 aa  84.3  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.658961  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  42.99 
 
 		 855 aa  82  0.00000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  42.39 
 
 		 1750 aa  77.8  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  46.49 
 
 		 1987 aa  75.5  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5348  peptidase M36 fungalysin  37.4 
 
 		 950 aa  70.9  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  40.57 
 
 		 1107 aa  70.1  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.72 
 
 		 1217 aa  69.7  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2024  hemagglutinin protein HagE  20.77 
 
 		 1706 aa  68.2  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.044838 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  38.18 
 
 		 869 aa  68.2  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43 
 
 		 1212 aa  67.4  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.000714594  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2120  Ig domain protein group 2 domain protein  37.88 
 
 		 1831 aa  65.9  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.348208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  37.72 
 
 		 972 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  37 
 
 		 868 aa  63.9  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0506  arginine-specific cysteine proteinase  21.4 
 
 		 736 aa  63.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.441013 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  37 
 
 		 867 aa  63.9  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  36 
 
 		 868 aa  62.4  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  36 
 
 		 868 aa  62  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  35.45 
 
 		 863 aa  60.8  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0625  PE-PGRS family protein  45.74 
 
 		 665 aa  60.8  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.215384  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  35.71 
 
 		 868 aa  60.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  42.86 
 
 		 14609 aa  60.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2974  PKD domain-containing protein  45.57 
 
 		 833 aa  60.1  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1205  hypothetical protein  23.15 
 
 		 884 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  37.35 
 
 		 994 aa  59.3  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1364  von Willebrand factor type A  35.97 
 
 		 1188 aa  58.5  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000145336  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0825  protease domain-containing protein  37.89 
 
 		 1258 aa  57.4  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.184637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1232  PKD domain-containing protein  43.48 
 
 		 2706 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.33 
 
 		 913 aa  55.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  33 
 
 		 3278 aa  55.5  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3141  protease domain-containing protein  32.48 
 
 		 1393 aa  55.5  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  35.59 
 
 		 1771 aa  55.5  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0007  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.97 
 
 		 911 aa  55.5  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289605 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3767  protease domain-containing protein  36.45 
 
 		 1311 aa  55.5  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000363962 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2474  hypothetical protein  39.13 
 
 		 826 aa  55.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.552746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2819  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA) protein-like omain  40.52 
 
 		 1394 aa  54.7  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0967207  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1180  hypothetical protein  38.89 
 
 		 902 aa  54.7  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4084  TPR repeat-containing protein  34.78 
 
 		 462 aa  54.7  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.806562  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  32.65 
 
 		 868 aa  53.9  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  33.67 
 
 		 868 aa  54.3  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5300  hypothetical protein  21.58 
 
 		 1103 aa  53.9  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.236434 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1112  hypothetical protein  37.78 
 
 		 901 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0403332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  47.44 
 
 		 692 aa  53.5  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  50.77 
 
 		 1107 aa  53.5  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0590  PE-PGRS family protein  42.55 
 
 		 665 aa  53.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2224  PKD domain-containing protein  42.86 
 
 		 460 aa  53.1  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4643  hypothetical protein  24.03 
 
 		 1017 aa  52  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.162315  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3768  protease domain-containing protein  36.21 
 
 		 1265 aa  51.6  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000500867  hitchhiker  0.00925065 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2764  PKD domain containing protein  40.23 
 
 		 1084 aa  51.6  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2647  hypothetical protein  39.1 
 
 		 1487 aa  51.2  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  32.09 
 
 		 884 aa  50.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1501  peptidase-like  37.5 
 
 		 1376 aa  50.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0114  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0797  protease domain-containing protein  32.48 
 
 		 1393 aa  50.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3882  leucine-rich repeat-containing protein  29.75 
 
 		 816 aa  50.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1879  hypothetical protein  28.16 
 
 		 882 aa  50.4  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.617309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0423  hypothetical protein  35.11 
 
 		 809 aa  50.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  31.91 
 
 		 611 aa  49.7  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0783  hypothetical protein  32.35 
 
 		 528 aa  49.7  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.07808  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4252  hypothetical protein  48.65 
 
 		 866 aa  49.3  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.908424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4047  hypothetical protein  23.53 
 
 		 882 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.353342  normal  0.0213567 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00841  PKD domain protein  36.59 
 
 		 1098 aa  48.9  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1644  PKD domain containing protein  47.54 
 
 		 820 aa  48.9  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2953  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  34.74 
 
 		 1004 aa  48.1  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.5475 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3321  hypothetical protein  39.34 
 
 		 1316 aa  47  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.72566 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2313  leucine-rich repeat-containing protein  27.96 
 
 		 450 aa  46.6  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1670  PKD domain containing protein  41.41 
 
 		 635 aa  46.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00387943  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0921  hypothetical protein  26.95 
 
 		 989 aa  46.2  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2254  PKD domain-containing protein  37.5 
 
 		 1011 aa  46.2  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000165849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2857  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1208 aa  45.8  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3279  PA14 domain protein  34.92 
 
 		 4009 aa  45.8  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0589032 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1787  polymorphic outer membrane protein  43.24 
 
 		 1332 aa  45.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3183  hypothetical protein  38.57 
 
 		 286 aa  45.4  0.006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  34.75 
 
 		 4357 aa  45.1  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1809  putative protease  31.52 
 
 		 656 aa  45.1  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.328878  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1500  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.78 
 
 		 1293 aa  45.1  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1743  PKD domain containing protein  41.41 
 
 		 635 aa  45.1  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.619925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  29.13 
 
 		 985 aa  44.7  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>