272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06955 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  49.88 
 
 		 863 aa  728    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  91.86 
 
 		 848 aa  1584    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  49.12 
 
 		 868 aa  734    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  49.41 
 
 		 869 aa  732    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  100 
 
 		 855 aa  1751    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  47.92 
 
 		 868 aa  709    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  47.6 
 
 		 868 aa  669    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  45.9 
 
 		 972 aa  668    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  49.24 
 
 		 868 aa  734    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  76.74 
 
 		 848 aa  1333    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  49.34 
 
 		 868 aa  714    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  49.53 
 
 		 867 aa  738    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  49.47 
 
 		 868 aa  737    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  51.01 
 
 		 563 aa  543  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  45.09 
 
 		 1271 aa  375  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  34.46 
 
 		 431 aa  245  3e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  29 
 
 		 674 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  29 
 
 		 674 aa  217  7e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  29 
 
 		 674 aa  217  8e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  29 
 
 		 674 aa  217  8e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  29 
 
 		 674 aa  217  9e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  29 
 
 		 674 aa  217  9e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  28.67 
 
 		 674 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  28.34 
 
 		 674 aa  213  9e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  27.96 
 
 		 674 aa  210  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  31.17 
 
 		 674 aa  209  2e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  29.3 
 
 		 674 aa  206  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  31.35 
 
 		 703 aa  196  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  29.36 
 
 		 861 aa  194  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  32.17 
 
 		 652 aa  193  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  29.86 
 
 		 792 aa  174  6.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  29.22 
 
 		 1080 aa  173  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  29.19 
 
 		 639 aa  171  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  30.57 
 
 		 484 aa  171  5e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  31.04 
 
 		 482 aa  170  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  27.41 
 
 		 652 aa  169  2e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  32.52 
 
 		 532 aa  167  6.9999999999999995e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  29.56 
 
 		 521 aa  165  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  29.38 
 
 		 540 aa  163  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  29.5 
 
 		 398 aa  160  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  29.73 
 
 		 651 aa  160  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  27.86 
 
 		 699 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  30.09 
 
 		 539 aa  159  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  27.45 
 
 		 699 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  30.14 
 
 		 505 aa  157  5.0000000000000005e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  34.91 
 
 		 373 aa  157  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  33.33 
 
 		 377 aa  155  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  26.96 
 
 		 699 aa  154  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  29.76 
 
 		 762 aa  154  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  30.35 
 
 		 854 aa  154  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  26.79 
 
 		 699 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  29.66 
 
 		 542 aa  153  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  26.79 
 
 		 699 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  29.46 
 
 		 430 aa  152  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  29.28 
 
 		 540 aa  144  5e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  28.83 
 
 		 662 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  28.57 
 
 		 536 aa  144  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  27.68 
 
 		 414 aa  143  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  26.75 
 
 		 451 aa  140  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  24.9 
 
 		 904 aa  139  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  30.89 
 
 		 388 aa  137  9e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  25.91 
 
 		 1146 aa  134  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02194  hypothetical protein  33.07 
 
 		 985 aa  134  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  32.1 
 
 		 364 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  27.84 
 
 		 997 aa  132  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  27.79 
 
 		 372 aa  132  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  26.91 
 
 		 439 aa  130  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  27.14 
 
 		 463 aa  129  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  27.75 
 
 		 559 aa  129  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  40 
 
 		 1057 aa  127  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  30.54 
 
 		 401 aa  127  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  25.31 
 
 		 1127 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  25.31 
 
 		 1127 aa  127  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  27.63 
 
 		 425 aa  126  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  27.03 
 
 		 675 aa  125  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  27.05 
 
 		 400 aa  125  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  25.31 
 
 		 1127 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  26.97 
 
 		 1051 aa  125  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  26.19 
 
 		 1127 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  31.19 
 
 		 382 aa  125  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  28.38 
 
 		 499 aa  123  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  26 
 
 		 1129 aa  122  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  26.24 
 
 		 1578 aa  119  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  29.25 
 
 		 355 aa  117  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  28.88 
 
 		 586 aa  115  3e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  25.59 
 
 		 1053 aa  115  4.0000000000000004e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  28.65 
 
 		 763 aa  115  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  24.32 
 
 		 657 aa  114  5e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  26.58 
 
 		 455 aa  114  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  34.27 
 
 		 765 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  25.77 
 
 		 1054 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  24.16 
 
 		 760 aa  112  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  25.56 
 
 		 472 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  24.24 
 
 		 1362 aa  110  9.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  23.64 
 
 		 634 aa  110  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  28.32 
 
 		 1782 aa  109  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  27.75 
 
 		 396 aa  109  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  35.06 
 
 		 816 aa  109  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  25.66 
 
 		 855 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  27.8 
 
 		 407 aa  109  3e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>