169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3356 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  100 
 
 
373 aa  770    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  53.45 
 
 
388 aa  377  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  42.67 
 
 
382 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  38.7 
 
 
377 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  37.71 
 
 
401 aa  230  4e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  38.39 
 
 
372 aa  216  7e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  35.1 
 
 
639 aa  215  9e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  38.01 
 
 
484 aa  213  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  39.34 
 
 
674 aa  210  3e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  39.34 
 
 
674 aa  210  3e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  36.04 
 
 
482 aa  210  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  39.34 
 
 
674 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  39.34 
 
 
674 aa  209  4e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  39.34 
 
 
674 aa  210  4e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  39.34 
 
 
674 aa  210  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  39.34 
 
 
674 aa  210  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  37.78 
 
 
674 aa  208  1e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  38.03 
 
 
674 aa  207  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  39.02 
 
 
674 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  38.69 
 
 
674 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4757  glycoside hydrolase family protein  35.55 
 
 
364 aa  195  9e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.385862  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  37.06 
 
 
431 aa  186  5e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  36.03 
 
 
521 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  35.87 
 
 
1271 aa  180  2.9999999999999997e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  31.07 
 
 
396 aa  172  1e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0868  glycosyl hydrolase family chitinase  34.6 
 
 
451 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  33.42 
 
 
652 aa  170  3e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  36.48 
 
 
867 aa  169  7e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  37.01 
 
 
868 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0763  Chitinase  33.54 
 
 
439 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.713777  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  37.34 
 
 
868 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  37.13 
 
 
868 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  36.04 
 
 
868 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  30.59 
 
 
355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  34.25 
 
 
854 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  30.51 
 
 
398 aa  164  3e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  36.69 
 
 
863 aa  164  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  35.71 
 
 
868 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  28.75 
 
 
762 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  35.5 
 
 
869 aa  161  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  30.53 
 
 
499 aa  159  6e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  31.93 
 
 
414 aa  159  9e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2725  glycoside hydrolase family protein  32.72 
 
 
426 aa  158  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00363291  hitchhiker  0.00148247 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  31.23 
 
 
1782 aa  154  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  34.82 
 
 
425 aa  153  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  35.69 
 
 
855 aa  152  1e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  30.49 
 
 
634 aa  151  2e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  32.89 
 
 
703 aa  151  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  33.76 
 
 
972 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  30.29 
 
 
430 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  30.67 
 
 
559 aa  150  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  33.33 
 
 
505 aa  150  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  34.32 
 
 
848 aa  150  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  32.63 
 
 
848 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  35.11 
 
 
868 aa  147  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 
652 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  30.11 
 
 
455 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  30.87 
 
 
1080 aa  143  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  31.45 
 
 
563 aa  142  8e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  27.75 
 
 
904 aa  141  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  29.77 
 
 
1578 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  31.52 
 
 
542 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  29.28 
 
 
463 aa  139  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  32.32 
 
 
536 aa  139  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  32.04 
 
 
563 aa  137  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  31.9 
 
 
662 aa  136  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  29.13 
 
 
407 aa  134  3e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  30.79 
 
 
763 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  30.57 
 
 
586 aa  133  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  25.99 
 
 
1146 aa  133  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  29.71 
 
 
472 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  26.83 
 
 
855 aa  132  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  29.1 
 
 
675 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00299  class V chitinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02800)  31.06 
 
 
366 aa  129  8.000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00128486  normal  0.5794 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  30.89 
 
 
792 aa  129  9.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3196  glycosyl hydrolase family chitinase  33.23 
 
 
861 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0825971  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2070  glycoside hydrolase family protein  28.94 
 
 
465 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1472  Chitinase  30 
 
 
540 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  30 
 
 
1246 aa  123  4e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3485  chitinase  30.28 
 
 
539 aa  123  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686156  normal  0.0640253 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  27.78 
 
 
1132 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.099502 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  26.82 
 
 
760 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3258  glycoside hydrolase family protein  28.85 
 
 
540 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.260959  normal  0.616625 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  27.74 
 
 
1051 aa  119  7.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03860  chitinase, putative  29.08 
 
 
827 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  28.9 
 
 
651 aa  117  3.9999999999999997e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  29.12 
 
 
532 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  30.58 
 
 
1362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  29.12 
 
 
1443 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0580  glycosyl hydrolase family chitinase  28.3 
 
 
400 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0019  exochitinase  34.21 
 
 
699 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.88911 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0020  exochitinase  34.21 
 
 
699 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.871167  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0021  exochitinase  34.21 
 
 
699 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.822563  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0020  exochitinase  34.21 
 
 
699 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.410319 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0020  exochitinase  34.54 
 
 
699 aa  113  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857408  normal  0.13273 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  30.58 
 
 
1127 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  30.24 
 
 
1127 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  30.58 
 
 
1127 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  30.58 
 
 
1127 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  30.66 
 
 
1129 aa  106  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>