209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3982 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  55.58 
 
 		 904 aa  867    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  53.41 
 
 		 772 aa  800    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  55.18 
 
 		 1054 aa  1036    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  54.81 
 
 		 1127 aa  1075    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  100 
 
 		 1146 aa  2351    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  54.81 
 
 		 1127 aa  1076    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  55.88 
 
 		 855 aa  824    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3559  chitinase  55.68 
 
 		 997 aa  812    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00432534  normal  0.147083 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  54.2 
 
 		 1053 aa  1015    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  55.09 
 
 		 1127 aa  1082    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  53.35 
 
 		 1129 aa  1046    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  55.7 
 
 		 1051 aa  972    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0592  putative chitinase  48.13 
 
 		 760 aa  684    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  54.53 
 
 		 1127 aa  1067    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0270  glycoside hydrolase family protein  40.65 
 
 		 484 aa  233  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0523  Chitinase  29.59 
 
 		 372 aa  206  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  31.72 
 
 		 703 aa  194  8e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  28.89 
 
 		 674 aa  183  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  28.69 
 
 		 674 aa  184  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  39.89 
 
 		 1152 aa  183  1e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  28.95 
 
 		 674 aa  183  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  28.95 
 
 		 674 aa  182  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  28.95 
 
 		 674 aa  183  2e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  28.95 
 
 		 674 aa  183  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  28.48 
 
 		 674 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  28.97 
 
 		 674 aa  182  2.9999999999999997e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  28.74 
 
 		 674 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  26.66 
 
 		 674 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  28.54 
 
 		 674 aa  178  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  28.76 
 
 		 652 aa  175  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1550  glycoside hydrolase family 18  28.97 
 
 		 482 aa  167  8e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0322184  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  25.28 
 
 		 634 aa  158  7e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2175  Chitinase  26.9 
 
 		 639 aa  157  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  26.67 
 
 		 848 aa  150  1.0000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3870  glycosyl hydrolase family chitinase  27.68 
 
 		 1271 aa  143  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.762403  normal  0.150806 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  27.51 
 
 		 848 aa  141  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06254  chitinase  26.6 
 
 		 431 aa  140  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  25.91 
 
 		 855 aa  134  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3356  Chitinase  25.99 
 
 		 373 aa  131  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.934755  normal  0.141475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3476  chitinase  26.37 
 
 		 499 aa  130  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3591  chitinase  26.91 
 
 		 401 aa  129  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21404 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01720  cytoplasm protein, putative  25.48 
 
 		 505 aa  128  7e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.256066  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  26.17 
 
 		 868 aa  127  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  25.32 
 
 		 868 aa  126  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  41.88 
 
 		 846 aa  126  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1460  glycosyl hydrolase family chitinase  28.03 
 
 		 763 aa  123  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.860815 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1284  glycoside hydrolase family 18  27.25 
 
 		 868 aa  122  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.113127  normal  0.562085 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  34.91 
 
 		 1406 aa  122  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  26.84 
 
 		 867 aa  121  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0361  glycoside hydrolase family 18  25.31 
 
 		 559 aa  121  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  27.79 
 
 		 521 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  36.71 
 
 		 1285 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  25.54 
 
 		 863 aa  120  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  26.41 
 
 		 868 aa  119  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  37.28 
 
 		 1047 aa  119  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2136  chitinase  25.34 
 
 		 869 aa  119  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000620509  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3093  glycoside hydrolase family protein  26.84 
 
 		 868 aa  118  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.73338  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  32.12 
 
 		 1096 aa  117  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  24.55 
 
 		 868 aa  116  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  38.46 
 
 		 1123 aa  115  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  39.78 
 
 		 846 aa  114  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  32.93 
 
 		 482 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2809  glycoside hydrolase family 18  28.28 
 
 		 396 aa  112  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08481  conserved hypothetical protein  26.73 
 
 		 1443 aa  112  6e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.293821  normal  0.840372 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00549  conserved hypothetical protein  26.33 
 
 		 1246 aa  110  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.500879 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  24.49 
 
 		 762 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2268  Chitinase  28.41 
 
 		 382 aa  111  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.149886 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0360  glycoside hydrolase family 18  25.05 
 
 		 652 aa  110  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13161  hypothetical protein  23.24 
 
 		 1080 aa  109  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  25.91 
 
 		 846 aa  107  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6135  glycoside hydrolase family 18  26.65 
 
 		 455 aa  107  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0191903 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  24.38 
 
 		 972 aa  107  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3442  glycosyl hydrolase family chitinase  25.58 
 
 		 414 aa  107  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0905047  normal  0.103323 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  37.04 
 
 		 848 aa  106  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  30.31 
 
 		 1219 aa  107  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0137  chitinase  23.46 
 
 		 563 aa  105  4e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  35.61 
 
 		 499 aa  105  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  26.87 
 
 		 854 aa  104  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1345  glycoside hydrolase family 18  26 
 
 		 377 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2284  Chitinase  25.98 
 
 		 425 aa  102  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.455176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  29.57 
 
 		 662 aa  103  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0603  glycoside hydrolase family protein  23.64 
 
 		 472 aa  102  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.238448  normal  0.0453952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6397  Chitinase  25.21 
 
 		 430 aa  101  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  33.47 
 
 		 1141 aa  100  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09390  Chitinase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9HFQ9]  28.35 
 
 		 1132 aa  99.8  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.099502 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04871  ChitinasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q92222]  26.99 
 
 		 398 aa  99  5e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.207138 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3086  glycoside hydrolase family 18  26.27 
 
 		 388 aa  99  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.800221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  25.7 
 
 		 1578 aa  98.6  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05077  conserved hypothetical protein  28.8 
 
 		 1782 aa  97.4  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.724169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6206  glycoside hydrolase family 18  30.19 
 
 		 536 aa  97.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05454  class V chitinase ChiB1 (AFU_orthologue; AFUA_8G01410)  27.05 
 
 		 463 aa  94.7  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000620499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  29.53 
 
 		 675 aa  94.7  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  29.68 
 
 		 532 aa  94  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2862  family 18 glycoside hydrolase  27.86 
 
 		 542 aa  92.8  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.857011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  26.32 
 
 		 792 aa  92  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  29.76 
 
 		 651 aa  92  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05170  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1204 aa  92  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31390  chitinase endochitinase 1 precursor  25.55 
 
 		 407 aa  89  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.888541  normal  0.285609 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  28.03 
 
 		 586 aa  88.6  7e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2572  glycoside hydrolase family protein  23.7 
 
 		 355 aa  88.2  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0142654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>