106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0682 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  100 
 
 		 1123 aa  2265    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2423  hypothetical protein  33.83 
 
 		 497 aa  207  9e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0123263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0276  hypothetical protein  34.39 
 
 		 491 aa  190  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.00000556159  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  42.79 
 
 		 1152 aa  147  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  41.97 
 
 		 1051 aa  138  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  42.33 
 
 		 1054 aa  137  9.999999999999999e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  39.68 
 
 		 1053 aa  120  9.999999999999999e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  34.68 
 
 		 1406 aa  118  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  38.78 
 
 		 846 aa  116  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  38.46 
 
 		 1146 aa  116  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  37.63 
 
 		 1127 aa  115  5e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  38.27 
 
 		 846 aa  114  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  37 
 
 		 1127 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  33.01 
 
 		 846 aa  112  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  36.5 
 
 		 1127 aa  110  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  34.67 
 
 		 848 aa  109  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  35.45 
 
 		 1059 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  36.17 
 
 		 1129 aa  104  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  35.26 
 
 		 1127 aa  103  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  46.67 
 
 		 703 aa  98.2  9e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  31.62 
 
 		 1285 aa  93.2  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  52.75 
 
 		 1362 aa  92.4  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  30.66 
 
 		 1047 aa  86.3  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  47.83 
 
 		 1132 aa  85.9  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05170  hypothetical protein  30.77 
 
 		 1204 aa  84  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.25 
 
 		 984 aa  80.5  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  37.44 
 
 		 482 aa  80.1  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  36.82 
 
 		 974 aa  80.5  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05607  hypothetical protein  28.77 
 
 		 962 aa  79  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  31.55 
 
 		 1224 aa  77  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  46.15 
 
 		 979 aa  74.7  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0591  putative chitinase  31.21 
 
 		 306 aa  74.3  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  39.1 
 
 		 1219 aa  74.3  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  36.68 
 
 		 1096 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  41.41 
 
 		 778 aa  72.4  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  35.43 
 
 		 1141 aa  71.6  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  41.18 
 
 		 1217 aa  71.6  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  34.42 
 
 		 1143 aa  70.9  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  36.29 
 
 		 991 aa  71.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  36.88 
 
 		 1474 aa  71.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  36.88 
 
 		 1585 aa  70.1  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  40.34 
 
 		 1002 aa  69.7  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  40.34 
 
 		 1247 aa  69.3  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  39.45 
 
 		 1275 aa  68.6  0.0000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.68 
 
 		 915 aa  68.2  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  29.45 
 
 		 1295 aa  67.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  37.97 
 
 		 675 aa  67.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  36.08 
 
 		 827 aa  67  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  37.63 
 
 		 692 aa  65.1  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  44.32 
 
 		 1414 aa  65.1  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  39.8 
 
 		 587 aa  64.7  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3892  hypothetical protein  40 
 
 		 550 aa  64.3  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0718789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1644  putative Ig  40.7 
 
 		 311 aa  62.4  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  42.86 
 
 		 767 aa  62.4  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.56 
 
 		 692 aa  61.2  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  38.89 
 
 		 618 aa  60.8  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  37.5 
 
 		 3911 aa  61.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  42.22 
 
 		 663 aa  60.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  36 
 
 		 343 aa  60.1  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.9 
 
 		 878 aa  59.7  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  41.03 
 
 		 1626 aa  59.7  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  37.93 
 
 		 1672 aa  59.3  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  30.96 
 
 		 14944 aa  59.3  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.51 
 
 		 587 aa  58.9  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5736  hypothetical protein  28.5 
 
 		 683 aa  58.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  32.87 
 
 		 1601 aa  58.5  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  30.4 
 
 		 499 aa  58.2  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1938  hypothetical protein  32.59 
 
 		 194 aa  58.2  0.0000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  34.15 
 
 		 12684 aa  58.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.77 
 
 		 626 aa  57.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2957  glycoside hydrolase family protein  37.61 
 
 		 966 aa  57.4  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  35.23 
 
 		 813 aa  58.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.36 
 
 		 1272 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  37.11 
 
 		 471 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3180  glycoside hydrolase family protein  40.4 
 
 		 963 aa  57  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000076749 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  41.76 
 
 		 491 aa  57.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  33.71 
 
 		 1879 aa  57  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  37.76 
 
 		 14609 aa  56.2  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  27.57 
 
 		 831 aa  56.2  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  31.32 
 
 		 1452 aa  55.8  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  35.96 
 
 		 1444 aa  55.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  48.21 
 
 		 1673 aa  54.7  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  32.58 
 
 		 1748 aa  54.3  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  30.93 
 
 		 1544 aa  54.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  35.06 
 
 		 1232 aa  54.7  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  32.73 
 
 		 717 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2831  Ig family protein  37.93 
 
 		 443 aa  53.9  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  0.161271 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  50 
 
 		 1222 aa  53.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3801  Ig family protein  44.83 
 
 		 1170 aa  53.1  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000269985  normal  0.432666 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  34.29 
 
 		 1160 aa  52  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  37.84 
 
 		 1129 aa  52  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  30.22 
 
 		 1457 aa  52  0.00007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  36.79 
 
 		 1031 aa  50.8  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  31.71 
 
 		 623 aa  51.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  32.67 
 
 		 1030 aa  50.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0188  Ig family protein  36.62 
 
 		 891 aa  50.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1602  Cna B domain-containing protein  29.05 
 
 		 2656 aa  49.7  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3112  N-acetylmuramyl-L-alanine amidase, negative regulator of AmpC, AmpD  29.41 
 
 		 496 aa  48.5  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  38.36 
 
 		 1394 aa  48.1  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  35.29 
 
 		 968 aa  47.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>