23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1644 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1644  putative Ig  100 
 
 		 311 aa  611  9.999999999999999e-175  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.132666  normal  0.459956 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2831  Ig family protein  37.29 
 
 		 443 aa  72.8  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal  0.161271 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  35.77 
 
 		 618 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  40.7 
 
 		 1123 aa  62.4  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0743  hypothetical protein  33.9 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0128528  decreased coverage  0.00133596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  32.07 
 
 		 3911 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  43.59 
 
 		 1672 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  36.79 
 
 		 1879 aa  59.3  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  38.71 
 
 		 1626 aa  56.2  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.21 
 
 		 692 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  38.3 
 
 		 1129 aa  55.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.23 
 
 		 1673 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  40.24 
 
 		 1222 aa  51.6  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.11 
 
 		 878 aa  50.8  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  36.08 
 
 		 1232 aa  49.7  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  34.31 
 
 		 1544 aa  49.3  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  41.94 
 
 		 471 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  35.56 
 
 		 1394 aa  44.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0188  Ig family protein  35.71 
 
 		 891 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1908  fibronectin, type III  25 
 
 		 968 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0431753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.36 
 
 		 1272 aa  44.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  29.25 
 
 		 813 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  31.68 
 
 		 3542 aa  43.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>