196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1238 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  100 
 
 		 1275 aa  2563    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2043  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 10 protein  56.42 
 
 		 1247 aa  856    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  63.16 
 
 		 1748 aa  609  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  48.48 
 
 		 1474 aa  546  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2379  xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 11 protein  60.04 
 
 		 1160 aa  546  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000600941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2042  CHU large protein, xylanase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 5 protein  48.09 
 
 		 1217 aa  544  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  48.24 
 
 		 1585 aa  541  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2040  esterase-like protein  56.07 
 
 		 1002 aa  525  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.400928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2268  hypothetical protein  46.56 
 
 		 615 aa  358  3.9999999999999996e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.457427  normal  0.399123 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  44.07 
 
 		 1223 aa  325  3e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  46.91 
 
 		 1295 aa  290  8e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1239  bifunctional acetylxylan esterase/xylanase, CBM4 module, glycoside hydrolase family 10 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  58.08 
 
 		 1414 aa  219  2e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.830301 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2773  putative topoisomerase  36.21 
 
 		 449 aa  203  9.999999999999999e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.243531 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2149  glycoside hydrolase family 5 protein  41.95 
 
 		 1108 aa  202  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000532282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4134  cellulose-binding family II  33.59 
 
 		 536 aa  189  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.16612  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2593  conserved repeat domain protein  39.24 
 
 		 3793 aa  189  3e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.073398 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  34.72 
 
 		 1657 aa  181  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1157  rhamnogalacturonan lyase  36.66 
 
 		 1266 aa  176  2.9999999999999996e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.219501  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  35.53 
 
 		 991 aa  165  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  36.5 
 
 		 1288 aa  155  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  38.92 
 
 		 2278 aa  154  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  43.31 
 
 		 1228 aa  143  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4979  Carbohydrate-binding family 9  35.92 
 
 		 1418 aa  135  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.502529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  36.7 
 
 		 1386 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2922  hypothetical protein  32.08 
 
 		 1329 aa  128  6e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0297077  normal  0.114251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5393  hypothetical protein  39.93 
 
 		 1303 aa  126  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  33.41 
 
 		 2270 aa  122  6e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1107  endoglucanase  39.4 
 
 		 1302 aa  110  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.480089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  26.03 
 
 		 989 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5714  putative acetyl xylan esterase  25.32 
 
 		 415 aa  107  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.785673  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  51.96 
 
 		 1152 aa  97.8  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0219  putative acetyl xylan esterase  28.09 
 
 		 398 aa  97.4  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  30.86 
 
 		 1050 aa  96.7  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2278  glycoside hydrolase family protein  29.91 
 
 		 1564 aa  95.9  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467525 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0549  Fibronectin type III domain protein  31.2 
 
 		 4429 aa  95.1  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  27.56 
 
 		 1068 aa  94  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1549  endo-1,4-beta-xylanase  29.8 
 
 		 1020 aa  92.8  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0176143  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1690  hypothetical protein  28.96 
 
 		 2713 aa  90.1  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0116  putative acetyl xylan esterase  36.94 
 
 		 437 aa  89  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.278656 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1505  hypothetical protein  39.86 
 
 		 429 aa  87.4  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738785  normal  0.270473 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0643  Carbohydrate-binding family 9  29.52 
 
 		 215 aa  87  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000132287  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3314  hypothetical protein  33.33 
 
 		 450 aa  87  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3862  endo-1,4-beta-xylanase  27.03 
 
 		 2457 aa  87.4  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  42.86 
 
 		 1406 aa  86.7  0.000000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  29.22 
 
 		 2286 aa  86.7  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0863  endo-1,4-beta-xylanase  28.12 
 
 		 1059 aa  85.9  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1871  hypothetical protein  26.6 
 
 		 794 aa  86.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00897497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0885  endo-1,4-beta-xylanase  28.12 
 
 		 1059 aa  85.9  0.000000000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.389282  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6546  hypothetical protein  36.67 
 
 		 421 aa  84.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.769373  normal  0.950041 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  43.33 
 
 		 1362 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2090  putative acetyl xylan esterase  35.95 
 
 		 397 aa  81.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.913278  normal  0.98056 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2510  Carbohydrate-binding family 9  31.28 
 
 		 626 aa  81.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6195  hypothetical protein  28.83 
 
 		 478 aa  80.9  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2661  hypothetical protein  24.54 
 
 		 792 aa  79.7  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247406  normal  0.0542382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3865  hypothetical protein  26.36 
 
 		 822 aa  80.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1101  endo-1,4-beta-xylanase  29.06 
 
 		 1018 aa  79.3  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.520079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0639  Endo-1,4-beta-xylanase  30.81 
 
 		 1215 aa  79  0.0000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.164422 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  27.19 
 
 		 1547 aa  79  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2642  GDSL family lipase  33.76 
 
 		 449 aa  79  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3126  putative acetyl xylan esterase  35.26 
 
 		 430 aa  79  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.635403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4909  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.43 
 
 		 915 aa  77.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.01005  normal  0.104643 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0638  Endo-1,4-beta-xylanase  30.6 
 
 		 1780 aa  77  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.806584 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  30.45 
 
 		 3324 aa  76.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4328  hypothetical protein  39.84 
 
 		 495 aa  76.3  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3033  putative acetyl xylan esterase  28.1 
 
 		 399 aa  75.5  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  28.37 
 
 		 1495 aa  72.4  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0353  beta-mannanase  42.86 
 
 		 815 aa  72.4  0.00000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3888  normal  0.500644 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  34.87 
 
 		 1601 aa  72.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1716  hypothetical protein  35.37 
 
 		 514 aa  72  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.722896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1398  hypothetical protein  29.66 
 
 		 799 aa  71.6  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.192264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  39.78 
 
 		 1132 aa  70.9  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3450  hypothetical protein  24.32 
 
 		 5453 aa  71.2  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.119049 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01025  hypothetical protein  28.84 
 
 		 2005 aa  71.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3802  protease  42.39 
 
 		 778 aa  70.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.239343 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1959  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  40.91 
 
 		 984 aa  69.7  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  29.9 
 
 		 1331 aa  69.7  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0490  hypothetical protein  37.3 
 
 		 691 aa  68.9  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.79487  normal  0.17216 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4722  Immunoglobulin V-set domain protein  33.62 
 
 		 994 aa  68.6  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.933088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.71 
 
 		 979 aa  67.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  39.45 
 
 		 1123 aa  68.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3463  Carbohydrate-binding family 9  27.46 
 
 		 691 aa  67  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0207696  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  32.04 
 
 		 4896 aa  66.6  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2225  gliding motility-related protein; adhesin AidA-related  27.49 
 
 		 2402 aa  65.9  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0807  hypothetical protein  40.86 
 
 		 587 aa  66.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0970671  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.71 
 
 		 1679 aa  66.2  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  36.56 
 
 		 703 aa  65.9  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  39.18 
 
 		 1059 aa  65.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.26 
 
 		 1343 aa  64.3  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3478  hypothetical protein  32.43 
 
 		 3737 aa  63.2  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1720  C-type lectin domain-containing protein  29.46 
 
 		 726 aa  62.8  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1648  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  32.12 
 
 		 1146 aa  62.8  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.479186  hitchhiker  0.00101634 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0342  Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase  25.12 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0231  endo-1,4-beta-xylanase  31.46 
 
 		 1041 aa  62.4  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540515  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  27.75 
 
 		 1141 aa  62.4  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  37.86 
 
 		 1127 aa  62  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3694  hypothetical protein  38.54 
 
 		 275 aa  61.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  28.12 
 
 		 4071 aa  61.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0791  hypothetical protein  43.66 
 
 		 692 aa  61.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.195904  normal  0.0459938 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4181  conserved repeat domain protein  28.64 
 
 		 1750 aa  61.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.46583  normal  0.246387 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  38.3 
 
 		 1051 aa  61.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>