135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1798 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 827 aa  1652    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  79.83 
 
 		 1096 aa  1298    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1796  Fibronectin type III domain protein  54.32 
 
 		 694 aa  620  1e-176  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.303311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  40.52 
 
 		 1219 aa  526  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1945  fibronectin type III domain-containing protein  43.7 
 
 		 1047 aa  286  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.771273  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  50.74 
 
 		 675 aa  263  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2452  Fibronectin type III domain protein  35.04 
 
 		 696 aa  232  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  44.03 
 
 		 499 aa  226  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  44.48 
 
 		 1141 aa  209  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  38.31 
 
 		 482 aa  200  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  37.34 
 
 		 777 aa  147  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  47.34 
 
 		 587 aa  144  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  41.28 
 
 		 549 aa  140  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  44.67 
 
 		 916 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.25 
 
 		 587 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0788  thermostable serine protease  39.06 
 
 		 606 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282797  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  34.71 
 
 		 606 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2223  peptidase-like protein  41.4 
 
 		 343 aa  119  3e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2852  beta-glycosidase-like protein  33.81 
 
 		 1152 aa  117  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.359276  normal  0.0739949 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.7 
 
 		 626 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.89 
 
 		 626 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  43.75 
 
 		 1439 aa  115  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.41 
 
 		 612 aa  101  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  36.49 
 
 		 1496 aa  99.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2399  hypothetical protein  33.51 
 
 		 1406 aa  94  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2327  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  28.94 
 
 		 12684 aa  91.3  7e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1285  hypothetical protein  36.91 
 
 		 491 aa  90.5  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000225466  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1066  hypothetical protein  31.05 
 
 		 744 aa  87  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000592577  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  43.64 
 
 		 2002 aa  84.7  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1090  hypothetical protein  31.58 
 
 		 771 aa  83.6  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  42.38 
 
 		 577 aa  82.4  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  44.68 
 
 		 2178 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000210  chitodextrinase precursor  40.13 
 
 		 1054 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0800752  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0837  FG-GAP repeat protein  31.68 
 
 		 895 aa  79  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0638  chitodextrinase  33.64 
 
 		 1051 aa  79  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0628  hypothetical protein  30.85 
 
 		 1457 aa  77.8  0.0000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.80698 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  28.05 
 
 		 846 aa  77.8  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5511  hypothetical protein  24.58 
 
 		 1452 aa  77  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  32.86 
 
 		 1127 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  28.02 
 
 		 848 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2168  Integrins alpha chain  48.91 
 
 		 534 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000439039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  32.86 
 
 		 1127 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  29.72 
 
 		 1285 aa  75.1  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  27.85 
 
 		 14944 aa  74.7  0.000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3982  glycosyl hydrolase family chitinase  31.15 
 
 		 1146 aa  73.9  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.317311 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.64 
 
 		 6885 aa  73.2  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05945  chitinase  38.29 
 
 		 1053 aa  73.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  26.73 
 
 		 846 aa  73.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  32.35 
 
 		 1127 aa  72.8  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  32.33 
 
 		 2192 aa  72  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3022  hypothetical protein  29.48 
 
 		 3586 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  29.33 
 
 		 1332 aa  70.1  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  26.62 
 
 		 846 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  31.88 
 
 		 1887 aa  68.9  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  31.92 
 
 		 1127 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  34.68 
 
 		 1059 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0682  putative Ig  35.58 
 
 		 1123 aa  67.4  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.929764  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  39.47 
 
 		 331 aa  67.4  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2719  glycoside hydrolase family protein  29.69 
 
 		 1129 aa  66.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0716218  hitchhiker  0.00441293 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  39.31 
 
 		 1537 aa  65.1  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0875  serine protease  37.96 
 
 		 663 aa  64.3  0.000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.923473  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  30.94 
 
 		 2170 aa  63.5  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1538 aa  62.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1516  pectate lyase protein  33.06 
 
 		 1031 aa  62.4  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000206035  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  36.41 
 
 		 743 aa  62  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0241  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  32 
 
 		 1143 aa  60.1  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000382571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  23.65 
 
 		 680 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  27.72 
 
 		 2286 aa  57.8  0.0000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  28.7 
 
 		 4761 aa  57.8  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  29.19 
 
 		 14609 aa  57.4  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  33.64 
 
 		 455 aa  56.6  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  31.56 
 
 		 1362 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  28.44 
 
 		 703 aa  56.6  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0677  periplasmic copper-binding  35.07 
 
 		 820 aa  55.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  25.38 
 
 		 5743 aa  55.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  29.72 
 
 		 1919 aa  55.1  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2709  BNR domain-containing protein  22.15 
 
 		 1554 aa  54.3  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  33.64 
 
 		 459 aa  54.7  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  30.91 
 
 		 455 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  33.03 
 
 		 455 aa  54.3  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  30.91 
 
 		 455 aa  54.3  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  30.95 
 
 		 455 aa  53.5  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  30 
 
 		 455 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  34.55 
 
 		 455 aa  53.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  31.65 
 
 		 455 aa  53.1  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  31.82 
 
 		 455 aa  52.4  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  31.82 
 
 		 455 aa  52.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  31.09 
 
 		 899 aa  52  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  32.17 
 
 		 458 aa  52  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  29.01 
 
 		 898 aa  51.6  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  33.79 
 
 		 458 aa  52  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2905  large repetitive protein  29.44 
 
 		 3824 aa  52  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2886  large repetitive protein  29.44 
 
 		 3824 aa  51.6  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.659132 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1287  periplasmic copper-binding  27.19 
 
 		 831 aa  51.6  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  30.39 
 
 		 767 aa  51.2  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0153  APHP domain protein  21.81 
 
 		 1224 aa  51.2  0.00007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3017  VCBS repeat-containing protein  29.44 
 
 		 3739 aa  51.2  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  30.05 
 
 		 809 aa  51.6  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.73 
 
 		 729 aa  51.2  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1238  beta-xylosidase/endoglucanase  36.61 
 
 		 1275 aa  51.2  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>