58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1155 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  100 
 
 		 1537 aa  3055    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  85.56 
 
 		 1538 aa  2559    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0576  hypothetical protein  55.88 
 
 		 1284 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  34.97 
 
 		 1141 aa  140  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0762  hypothetical protein  36.46 
 
 		 1439 aa  119  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00323253  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  31.23 
 
 		 2026 aa  108  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  55.14 
 
 		 2178 aa  107  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0292  fibronectin type III domain-containing protein  41.03 
 
 		 916 aa  108  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.525273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3562  filamentous hemeagglutinin outer membrane protein  49.62 
 
 		 577 aa  107  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  39.66 
 
 		 1496 aa  102  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0754  fibronectin type III domain-containing protein  50.83 
 
 		 2192 aa  96.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  34.8 
 
 		 1438 aa  92.4  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  25.05 
 
 		 2912 aa  89.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1242  hypothetical protein  36.75 
 
 		 549 aa  82.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.74975e-30 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  30.09 
 
 		 1281 aa  80.9  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  29.5 
 
 		 2499 aa  77.4  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2445  fibronectin, type III domain-containing protein  30.81 
 
 		 499 aa  76.3  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.628775  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  33.72 
 
 		 2081 aa  72.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1320  hypothetical protein  39.6 
 
 		 777 aa  71.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000232638  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  30.74 
 
 		 1330 aa  70.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  31.93 
 
 		 1329 aa  70.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  29.46 
 
 		 675 aa  69.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  40 
 
 		 2002 aa  68.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  31.51 
 
 		 1329 aa  68.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1799  Fibronectin type III domain protein  30.77 
 
 		 1096 aa  66.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  26.4 
 
 		 939 aa  63.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  28.86 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  30.59 
 
 		 1645 aa  62.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  28.52 
 
 		 455 aa  60.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  33.19 
 
 		 1525 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  33.15 
 
 		 1454 aa  57.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  25.73 
 
 		 1110 aa  57  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  32.79 
 
 		 336 aa  57.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2451  Fibronectin type III domain protein  30.79 
 
 		 1219 aa  57.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  32.52 
 
 		 457 aa  57  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1798  Fibronectin type III domain protein  40.31 
 
 		 827 aa  57  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  27.64 
 
 		 1038 aa  57  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1294 aa  56.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  30.9 
 
 		 655 aa  56.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  27.19 
 
 		 1453 aa  56.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  26.08 
 
 		 1106 aa  55.5  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2904  cytochrome C family protein  32.72 
 
 		 655 aa  53.9  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  25.85 
 
 		 957 aa  54.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  26.32 
 
 		 2222 aa  54.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2998  cytochrome C family protein  32.72 
 
 		 655 aa  54.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0215  multihaem cytochrome  29.19 
 
 		 563 aa  52.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.354833  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  36.73 
 
 		 331 aa  51.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  25.24 
 
 		 902 aa  51.2  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  29.2 
 
 		 1036 aa  50.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  27.27 
 
 		 958 aa  49.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  27.27 
 
 		 958 aa  49.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3100  Peptidase M23  35.59 
 
 		 954 aa  47.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1827  cytochrome C family protein  29.05 
 
 		 656 aa  47.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.287996  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  27.31 
 
 		 1046 aa  47.8  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  26.15 
 
 		 1053 aa  47  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  27.46 
 
 		 955 aa  46.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  28.07 
 
 		 1457 aa  45.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2327  fibronectin, type III domain-containing protein  30.37 
 
 		 482 aa  45.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00610541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>