63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0497 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1193  cytochrome C family protein  39.24 
 
 		 1018 aa  651    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  41.62 
 
 		 1017 aa  671    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0497  cytochrome C family protein  100 
 
 		 1053 aa  2168    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3057  cytochrome C family protein  40.22 
 
 		 1017 aa  665    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2912  cytochrome c family protein  39.95 
 
 		 1046 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.802585  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  42.22 
 
 		 1038 aa  681    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0558  cytochrome c family protein  38.63 
 
 		 1036 aa  624  1e-177  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  35.47 
 
 		 1009 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1834  cytochrome C family protein  38.72 
 
 		 1611 aa  402  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3543  cytochrome C family protein  36.84 
 
 		 957 aa  319  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  36.59 
 
 		 955 aa  320  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1153  cytochrome C family protein  38.02 
 
 		 958 aa  317  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3470  cytochrome C family protein  37.87 
 
 		 958 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  35.92 
 
 		 902 aa  296  1e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1198  cytochrome C family protein  37.45 
 
 		 1143 aa  261  4e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3052  cytochrome C family protein  37.62 
 
 		 1143 aa  255  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  42.22 
 
 		 1294 aa  251  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3544  cytochrome C family protein  37.07 
 
 		 1106 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  33.19 
 
 		 1110 aa  208  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3427  cytochrome C family protein  28.5 
 
 		 1457 aa  199  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.476422  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0498  cytochrome C family protein  29.21 
 
 		 1281 aa  179  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.618718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  25.32 
 
 		 2026 aa  90.9  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3426  cytochrome C family protein  26.62 
 
 		 901 aa  88.2  7e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.360069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3563  cytochrome C family protein  28.83 
 
 		 1276 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0499  cytochrome C family protein  25.19 
 
 		 1379 aa  82  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00294186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2899  high-molecular-weight cytochrome c  32.72 
 
 		 979 aa  82  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0580  high-molecular-weight cytochrome c  30.75 
 
 		 869 aa  80.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  24.5 
 
 		 2499 aa  77.4  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  25.98 
 
 		 2803 aa  77.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  24.45 
 
 		 1454 aa  75.5  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3049  cytochrome C family protein  25.36 
 
 		 2081 aa  75.1  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3724  cytochrome C family protein  29.04 
 
 		 1691 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  25.97 
 
 		 2912 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  26.17 
 
 		 2222 aa  72.8  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2035  cytochrome C family protein  32.27 
 
 		 1596 aa  70.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0398  cytochrome C family protein  30.28 
 
 		 672 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  26.61 
 
 		 1453 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  27.81 
 
 		 1916 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  24.47 
 
 		 1196 aa  69.3  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0573  cytochrome C family protein  27.02 
 
 		 1672 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0575  cytochrome c family protein  22.66 
 
 		 1127 aa  68.2  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1823  cytochrome C family protein  24.89 
 
 		 1525 aa  68.2  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3077  multihaem cytochrome  27.1 
 
 		 1330 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1826  cytochrome C family protein  27.29 
 
 		 1645 aa  67  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3174  cytochrome C family protein  26.53 
 
 		 1329 aa  66.2  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.246364  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3268  cytochrome C family protein  27.87 
 
 		 1329 aa  66.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2903  cytochrome C family protein  28.3 
 
 		 455 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  30.95 
 
 		 1438 aa  63.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2815  cytochrome c like protein  25.86 
 
 		 457 aa  63.5  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2470  high-molecular-weight cytochrome c  23.6 
 
 		 1521 aa  62.8  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2997  cytochrome C family protein  26.88 
 
 		 455 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.742851  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6276  cytochrome C family protein  30.11 
 
 		 501 aa  56.2  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.943991 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  27.51 
 
 		 1848 aa  56.2  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2882  cytochrome c family protein  25.26 
 
 		 688 aa  56.2  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  24 
 
 		 299 aa  54.7  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  25.06 
 
 		 939 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2762  cytochrome C family protein  25 
 
 		 454 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2816  cytochrome c like protein  25.84 
 
 		 655 aa  48.9  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16928  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  26.15 
 
 		 1537 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  23.87 
 
 		 299 aa  45.8  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2763  cytochrome C family protein  25.94 
 
 		 336 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.888791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0029  fibronectin, type III  23.31 
 
 		 742 aa  45.8  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.795527  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2507  hypothetical protein  31.58 
 
 		 700 aa  45.1  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.116766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>